使用photoshop及ImageJ处理克隆形成实验结果 |
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首先打开PS,截取需要处理的部分,放大图片更容易处理(比例选的 45%,根据需要调整) Fig 12.选择工具栏中的尺子量直径,记住宽度为1697像素 Fig 23.用椭圆工具将圆抠下来(选中这些指标后,右键会出现虚线的圆),新建剪切板,将圆粘贴到剪切板,保存即可 Fig 3aFig 3b4.将图片直接拖拽到image J中打开 a.在Image选项选择type,调整为8bits,调为灰色图片; b在Image选项选择adjust,调整Brightness/contrast(亮度及克隆与背景的对比度),可以直接选择Auto; c.在Image选项选择adjust,调整Threshold,可以直接选择Auto;克隆变成默认的红色 Fig 4aFig 4bFig 4cFig 4dFig 4e5.分析 选中Analyze Particles Size:选择细胞大小形状,默认是0-无穷,可以根据自己需求调整 Circularity:0-1指的是所有形状的都计数 Show一般选择outlines,会出现选择的细胞的轮廓 选中展示结果及总结 (PS:results中的Mean,Min以及Max这几列还不太清楚是什么意思,有知道的童鞋欢迎补充呀>__ |
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