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目前，高通量测序技术日渐成熟，也成为生命科学领域研究中的重要工具之一。

获取样本，送公司测序，对测序数据进行分析，根据分析结果进行实验验证并撰写文章，最后投稿，这也是当下常规的「套路」之一。

不过，在投稿前或者文章正式见刊前，我们是需要将测序的数据上传到国际公认的数据库，公开自己的数据，共享自己的数据。

那么，我们该如何上传自己的数据到公共数据库呢？

今天，小编就以上传高通量数据到 NCBI 为例进行讲解，毕竟 NCBI 是大家最常用的公共数据库。

NCBI 数据库的官网如下，该数据库包罗万象，不过今天我们仅仅关注其中的一个 ---GEO DataSets。

（图片来源：网页截图）

如果想上传数据，可以直接按如下网址打开相应网页：

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/submission.html

打开之后，需要点击右上角的 Login 进行登录，如果之前大家没有注册过 NCBI 的账号，那么需要先注册，之后再登录。

登录之后，我们就可以根据提示来上传我们的数据了。

首先，根据数据类型，我们选择高通量测序数据。

正式上传数据之前，有几个文件需要我们提前准备，下图红框中的三个文件是必须要提供的，否则将无法上传。

第一个文件是metadata，可以在官网下载模版进行填写。这个文件就是来交代数据的一些基本信息的，比如样本来源，测序平台，文件名称，主要贡献者之类的。

（图片来源：网页截图）

第二个文件是Processed data，这个是数据分析中的过程文件，可以是原始的 count 文件，也可以是标准化之后的矩阵文件。当然，也可以是其他的一些格式的文件，只要格式正确，文件准确，均可。

第三个需要准备的文件是原始文件，这个也就是测序公司给你的原始的测序数据文件，是没有经过任何处理的文件，通常是 fastq 文件。

以上三个文件准备好之后，把它们放到一个文件夹中，准备工作就算完成了，接下来就是上传文件了。

如果你已经登录，那么点击上图的 "Transfer Files" 之后，会看到以下界面。这里会给你提供两个非常重要的信息：

第一：你个人的文件存放目录；

（图片来源：网页截图）

第二：host 地址，用户名及密码。这两个信息是非常重要的，在接下来的上传过程中是必须要用到的。

上传数据时，我们需要借助一些工具进行。在这里，我推荐FileZilla Client这个软件。因为该软件在多个系统均可安装运行，非常方便。

第一步：

下载安装 FileZilla Client 之后，打开该软件，首先填写上面我们提到的第二个重要信息，也就是 host 地址，用户名及密码，之后点击快速连接，这时我们会看到一个错误提示（下图红框部分），忽略该提示，进行下一步操作。

（图片来源：软件截图）

第二步：

在远程节点那一栏填上（下图红框部分）我们上文中提到的第一个重要信息：个人的文件存放目录。回车之后就进入了你在 NCBI 的个人目录中。

简单来说，左边是你本地电脑的目录及目录下的文件，右边是你在 NCBI 的目录文件。此时，将左边的文件直接拖拽到右侧，即可进行上传。但是，为了使你的上传过程比较顺利，下面有几个小技巧分享给大家。

技巧一：保存登录密码；

技巧二：保存设置好的节点，这样就可以避免每次登录都要输入节点、用户名及密码的麻烦了；

技巧三：设置远程节点，这也是为了避免重复输入到麻烦；

技巧四：打开软件，直接进行连接，方便又快捷。

数据上传结束之后，你需要告知 GEO 的工作人员，否则两周后你上传的数据就会自动删除。

之前，上传完数据之后需要给 GEO 的工作人员发邮件告知，而现在就比较简单了，点击下图的 "Notify GEO"，然后在新的页面将你上传数据的目录写清楚，数据公开的期限等信息，提交就可以了。

提交成功之后，GEO 官网会给你发送一封邮件，告知你已经收到你的申请，工作人员会检查你上传的数据是否完整，格式是否正确等。

如果存在问题，工作人员会通过邮件告知你；如果数据没有问题，那么工作人员也会通过邮件告知你，并提供GSE 号，这个号码也是你文章中所需要的。

最后，祝大家早发 paper 早毕业～

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