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enrich_barplot
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【这图怎么画】系列的图都来自VIP群里同学的提问。推文只是对图片的复现,不代表作者对图片展现形式的认同。欢迎同学们在群里分析有意思的图片。 本期图片 enrich_barplot ❝Title:The multiomics landscape of serum exosomes during the development of sepsis 期刊:Journal of Advanced Research Doi:https://doi.org/10.1016/j.jare.2021.11.005 ❞相比于以往的富集分析可视化形式:GOplot | 更美观的富集分析可视化,本图将pvalue以及富集「基因数」都用条形图来展示,看上去更直观一点。 ❝刚开始以为是很普通的双向柱状图(正负条形图),后来发现颜色和坐标轴标签都不好修改,因此还是用了拼图。「这期写的一般,有更好办法的同学欢迎私信反馈」。 ❞ 复现结果 复现结果 示例数据和代码领取详见:这图怎么画| 富集分析之双向柱状图 绘图 # 创建示例数据 dt = data.frame(pathway = paste('pathway',1:20), Classification = rep(paste('Class',1:5),4), pvalue = runif(20,0.0001,0.05), count = floor(runif(20,5,20))) head(dt) dt = dt[order(dt$Classification),] dt$pathway = factor(dt$pathway, levels = dt$pathway) library(ggplot2) # 左图 p1 |
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