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Rt-qPCR(实时荧光定量PCR)是分子生物学的基础实验,主要包括三大步骤:RNA提取、逆转录成cDNA、实时荧光定量PCR。虽然看起来逆转录实验只是将几种试剂加在离心管中混匀,进行反应即可,但在实际操作过程中,还有许多细节需要注意。 根据其化学原理不同,Rt-qPCR可以分为2种检测方法:一种为探针法,如TaqMan探针法;一种为染料法,如SYBR Green Ⅰ染料法。今天来给大家分享一下做Rt-qPCR实验(SYBR染料法)时的加样心得,助力大家在做Rt-qPCR实验时,加样高效又准确! 01 上样前的点样规划首先,根据实验需要进行96孔板孔位规划,实验需要满足3个技术重复及至少3个生物学重复。 假设一次实验需要检测8个样品中3种目的基因表达,则需要的孔位数为: 8(样品数)×4(目的基因数+内参基因)×3(三个技术重复)=96。 如下图所示96孔板示意图(从上到下依次为A-H,从左到右依次为1-12),每个大方框(橙色/蓝色)内是同一种cDNA,A列及E列均加上内参基因的引物。3种目的基因(如基因A、B、C)分别按如下分布: 02准备试剂和样品将Rt-qPCR所需要的试剂如:无酶水,SYBR,上下游引物等以及样品(cDNA)置于冰上备用。 03混合无酶水、SYBR、上下游引物根据以上点样规划,计算每种引物所在位置孔位数,如内参基因为A列及E列上样,需要加24个孔,一般配Mix时需要多配2个孔,我们按26个孔的量,除cDNA(1μL)后需配置余下体系。 准备一个EP管,按照试剂盒提示(此为takara试剂盒上样体系,共计20μL)分别计算: 无酶水:7.4μL×26=192.4μL SYBR:10μL×26=260μL 上下游引物各:0.8μL×26=20.8μL 展开全文26个孔混合物的总量:19μL×26=494μL=260μL+20.8×2μL+192.4μL 充分混合均匀,置冰上备用。按照同样的方法分别配置含有目的基因的混合物。 04 上样第一次上样:将上述混合物按照点样规划加入相应孔位,例如A列及E列均加含有内参基因的混合物,每孔19μL。 Tips:每次加入小孔底部,不用更换枪头,加含有另一种引物的混合物时再更换。 第二次上样:每孔加入1μL cDNA。 Tips:为了避免污染,每次需更换枪头。 为了提高上样准确性,教大家2个上样小妙招: ① 首先,根据实验需要进行96孔板孔位规划,实验需要满足3个技术重复及至少3个生物学重复。 ② 准备好一个完整的无酶10μL枪头盒,对应好96孔板位置取用枪头,避免上样失误。 05上机上样完成后,贴好封板膜,离心(一定要记得离心!!!否则上机后没有底物不反应或混合不均实验差异大),使体系全部混合后再上机。如果因不可抗力不能及时上机,需将96孔板置于4℃避光保存(亲测4℃放置4h左右再上机也不影响结果)。 以上是跟大家分享的Rt-qPCR实验的加样技巧,希望帮助大家更顺利的完成实验~返回搜狐,查看更多 责任编辑: |
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