使用实时荧光定量 PCR 分析拷贝数变异 (CNV)

您所在的位置:网站首页 实时荧光定量pcr分析 使用实时荧光定量 PCR 分析拷贝数变异 (CNV)

使用实时荧光定量 PCR 分析拷贝数变异 (CNV)

2024-05-13 23:59| 来源: 网络整理| 查看: 265

Applied Biosystems TaqMan 拷贝数测定将 TaqMan MGB 探针化学原理与 Applied Biosystems 实时荧光定量 PCR 仪器结合在一起,提供了一种获得特异性、可重现和易于理解的拷贝数结果的方法。这种快速而简单的方法可以在数小时而不是数天内完成。使用 TaqMan 拷贝数测定来筛选特定靶标,可以提供能够在一日内自动处理成百上千份样本的工作流程。而且由于 TaqMan 测定是精准靶标定量的金标准,因此它们适合用于后续的微阵列研究。

TaqMan 拷贝数测定试剂盒系列包括以下产品:

预先设计的 TaqMan 拷贝数检测试剂盒

人类:超过160万个预先设计的可用于全基因组覆盖范围的检测小鼠:超过18万个预先设计的用于基因外显子的检测普通载体标记和报告基因测定 

定制 Plus TaqMan 拷贝数测定

提交用户定义的人类或小鼠基因组靶标,包括前期生物信息序列分析和计算机模拟质量控制

其他感兴趣靶标的自定义 TaqMan 拷贝数检测试剂盒

提交任何隐藏的靶标序列以用于检测试剂盒设计提交引物/探针配对的序列以用于检测试剂盒合成不包括前期生物信息序列分析或计算机模拟质量控制

人类和小鼠 TaqMan 拷贝数参比测定也是可用的。

作为研究拷贝数变异简单的方法,TaqMan 拷贝数测定试剂盒订购方便,流程简单,能够快速给出结果。 

TaqMan 拷贝数测定视频手册 ›

实验工作流程(人类和动物):查找到每一步所需的产品

对于植物样本,请访问我们的农业基因组学部分。

Step 1制备样本Step 2选择测定试剂盒Step 3扩增 DNAStep 4分析数据 分离和纯化基因组 DNA。 步骤1需要的产品:制备样本

DNA 分离试剂盒 从血液、细胞、组织、质粒和更多样本中分离 DNA 的试剂盒。

为检测测定选择和设计 TaqMan 探针。对于人类样本,选择 RNase P 或 TERT 参比测定试剂盒。对于小鼠样本,选择 Tfrc 或 Tert 参比测定试剂盒。 

预先设计的 TaqMan 拷贝数测定试剂盒Applied Biosystems TaqMan 拷贝数测定试剂盒专为 CNV 分析而设计,包含了160多万个全基因组覆盖的人类测定。小鼠系列包含了 18 万个靶向基因外显子区域的检测。也有可用于转基因研究的常用载体标记和报告基因测定。 

定制和定制 Plus TaqMan 拷贝数测定试剂盒定制和定制 Plus TaqMan 拷贝数测定试剂盒让您能够获得特异性、可重现和易于理解的拷贝数结果。它们是验证研究和大规模样本筛查的理想工具。定制 Plus 测定试剂盒帮助确定人类或小鼠基因组靶标,并具有与预先设计的拷贝数测定试剂盒相同的质量。定制 Plus 测定试剂盒进行深入的生物信息学分析,包括单核苷酸多态性和重复序列掩盖,以及基因组特异性检查。定制 TaqMan 拷贝数测定试剂盒不受物种限制,它们可以为任何靶标序列设计。但是定制测定试剂盒不包含任何前期生物信息学序列分析或计算机模拟质量控制。

TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒Applied Biosystems TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒与预先设计的定制 Plus 和定制 TaqMan 拷贝数测定试剂盒一起进行双重实时荧光定量 PCR 反应来检测和测量人类和小鼠基因组的拷贝数变异。

TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,人类,RNase P,750次反应TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,人类,RNase P,3000次反应TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,人类,TERT,750次反应TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,人类,TERT,3000次反应TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,小鼠,Tfrc,750次反应TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,小鼠,Tfrc,3,000次反应TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,小鼠,Tert,750次反应TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,小鼠,Tert,3,000次反应 使用序列特异性的引物和 TaqMan 探针在 Applied Biosystems 实时荧光定量 PCR 系统上制备反应板并扩增 DNA。备注:TaqMan 拷贝数测定试剂盒(检测测定试剂盒)与您选择的 TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒同时运行。  试剂和试剂盒

TaqPath ProAmp 预混液*Applied Biosystems TaqPath ProAmp 预混液为多功能的预混液,专门针对含 PCR 抑制剂样本的高通量基因型分析和需要精准结果的拷贝数变异方案而开发。TaqPath ProAmp 预混液包含 Applied Biosystems ROX 惰性参比染料,可以用于达3个靶标的较低多重分析。

TaqPath ProAmp 多重分析预混液*TaqPath ProAmp 预混液为多功能的预混液,专门针对含 PCR 抑制剂样本的高通量基因型分析和需要精准结果的拷贝数变异方案而开发。TaqPath ProAmp 多重分析预混液包含 Applied Biosystems MUSTANG PURPLE 惰性参比染料,可以用于达4个靶标的较高多重分析。

* 通用试剂:TaqPath 预混液是在 ISO 13485 认证工厂里生产的通用试剂,标有"仅供实验室使用"。

仪器和附件

ProFlex PCR 系统Applied Biosystems ProFlex PCR 系统秉承了 Applied Biosystems 热循环仪所期望的可靠性和性能,并具有适合您现在工作方式的灵活配置和控制功能。可更换的模块形式允许您灵活变换实验通量或同时运行独立的实验。

SimpliAmp 热循环仪Applied Biosystems SimpliAmp 热循环仪简单易用、设计紧凑且准确度高,旨在满足各实验室的 PCR 基本工作流程的要求。响应式彩色触摸屏和 Applied Biosystems VeriFlex 温度控制技术等创新实现了简单、准确的优化。 

使用数据分析软件计算同一个运行中的一组样本可能的拷贝数,为每个拷贝数识别提供了可信的数据,并去除您数据中的任何离群值。 软件

CopyCaller 软件CopyCaller 软件让您能使用预先设计的定制 Plus 或定制 TaqMan 拷贝数测定试剂盒的实时荧光定量 PCR 数据进行基因组靶标的相对定量分析。软件和相关的拷贝数测定试剂盒可以用于检测和测量人类及小鼠基因组特定序列的拷贝数变异。 

 下载

Step 1 : 制备样本 分离和纯化基因组 DNA。 步骤1需要的产品:制备样本

DNA 分离试剂盒 从血液、细胞、组织、质粒和更多样本中分离 DNA 的试剂盒。

Step 2 : 选择测定试剂盒 为检测测定选择和设计 TaqMan 探针。对于人类样本,选择 RNase P 或 TERT 参比测定试剂盒。对于小鼠样本,选择 Tfrc 或 Tert 参比测定试剂盒。 

预先设计的 TaqMan 拷贝数测定试剂盒Applied Biosystems TaqMan 拷贝数测定试剂盒专为 CNV 分析而设计,包含了160多万个全基因组覆盖的人类测定。小鼠系列包含了 18 万个靶向基因外显子区域的检测。也有可用于转基因研究的常用载体标记和报告基因测定。 

定制和定制 Plus TaqMan 拷贝数测定试剂盒定制和定制 Plus TaqMan 拷贝数测定试剂盒让您能够获得特异性、可重现和易于理解的拷贝数结果。它们是验证研究和大规模样本筛查的理想工具。定制 Plus 测定试剂盒帮助确定人类或小鼠基因组靶标,并具有与预先设计的拷贝数测定试剂盒相同的质量。定制 Plus 测定试剂盒进行深入的生物信息学分析,包括单核苷酸多态性和重复序列掩盖,以及基因组特异性检查。定制 TaqMan 拷贝数测定试剂盒不受物种限制,它们可以为任何靶标序列设计。但是定制测定试剂盒不包含任何前期生物信息学序列分析或计算机模拟质量控制。

TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒Applied Biosystems TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒与预先设计的定制 Plus 和定制 TaqMan 拷贝数测定试剂盒一起进行双重实时荧光定量 PCR 反应来检测和测量人类和小鼠基因组的拷贝数变异。

TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,人类,RNase P,750次反应TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,人类,RNase P,3000次反应TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,人类,TERT,750次反应TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,人类,TERT,3000次反应TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,小鼠,Tfrc,750次反应TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,小鼠,Tfrc,3,000次反应TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,小鼠,Tert,750次反应TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒,小鼠,Tert,3,000次反应 Step 3 : 扩增 DNA 使用序列特异性的引物和 TaqMan 探针在 Applied Biosystems 实时荧光定量 PCR 系统上制备反应板并扩增 DNA。备注:TaqMan 拷贝数测定试剂盒(检测测定试剂盒)与您选择的 TaqMan 拷贝数参比测定试剂盒同时运行。  试剂和试剂盒

TaqPath ProAmp 预混液*Applied Biosystems TaqPath ProAmp 预混液为多功能的预混液,专门针对含 PCR 抑制剂样本的高通量基因型分析和需要精准结果的拷贝数变异方案而开发。TaqPath ProAmp 预混液包含 Applied Biosystems ROX 惰性参比染料,可以用于达3个靶标的较低多重分析。

TaqPath ProAmp 多重分析预混液*TaqPath ProAmp 预混液为多功能的预混液,专门针对含 PCR 抑制剂样本的高通量基因型分析和需要精准结果的拷贝数变异方案而开发。TaqPath ProAmp 多重分析预混液包含 Applied Biosystems MUSTANG PURPLE 惰性参比染料,可以用于达4个靶标的较高多重分析。

* 通用试剂:TaqPath 预混液是在 ISO 13485 认证工厂里生产的通用试剂,标有"仅供实验室使用"。

仪器和附件

ProFlex PCR 系统Applied Biosystems ProFlex PCR 系统秉承了 Applied Biosystems 热循环仪所期望的可靠性和性能,并具有适合您现在工作方式的灵活配置和控制功能。可更换的模块形式允许您灵活变换实验通量或同时运行独立的实验。

SimpliAmp 热循环仪Applied Biosystems SimpliAmp 热循环仪简单易用、设计紧凑且准确度高,旨在满足各实验室的 PCR 基本工作流程的要求。响应式彩色触摸屏和 Applied Biosystems VeriFlex 温度控制技术等创新实现了简单、准确的优化。 

Step 4 : 分析数据 使用数据分析软件计算同一个运行中的一组样本可能的拷贝数,为每个拷贝数识别提供了可信的数据,并去除您数据中的任何离群值。 软件

CopyCaller 软件CopyCaller 软件让您能使用预先设计的定制 Plus 或定制 TaqMan 拷贝数测定试剂盒的实时荧光定量 PCR 数据进行基因组靶标的相对定量分析。软件和相关的拷贝数测定试剂盒可以用于检测和测量人类及小鼠基因组特定序列的拷贝数变异。 

 下载

相关资源

产品简报

TaqMan 拷贝数测定试剂盒

 海报

使用实时定量 PCR 测定基因的拷贝数基于从 HapMap 项目数据库中推断基因组范围内连锁不平衡模式选择 SNP 来进行基因组相关研究

应用文档

拷贝数变异分析:设计管线和 TaqMan 拷贝数测定试剂盒验证

背景参考文献(网络) 

Copy Number Variants and Common Disorders: Filling the Gaps and Exploring Complexity in Genome-Wide Association Studies PLoS Genet 2007; 3(10): e190. doi:10.1371/journal.pgen.0030190 Authors: Estivill X., et. al.Detection of large-scale variation in the human genome Nature Genetics 2004; 36, 949 - 951 Authors: A John Iafrate, et. al.Large-Scale Copy Number Polymorphism in the Human Genome Science 23 July 2004: Vol. 305. no. 5683, pp. 525 - 528 Authors: Jonathan Sebat, et. al.Global variation in copy number in the human genome Nature 444, 444-454 (23 November 2006) Authors: Richard Redon, et. al.

引用文献(网络) 

Differential quantification of CYP2D6 gene copy number by four quantitative real-time PCR assays Pharmacogenetics and Genomics 2010, 20:451-454.Authors: Anuradha Ramamoorthy, et al.Recurrent microdeletions at 15q11.2 and 16p13.11 predispose to idiopathic generalized epilepsies Brain.2010; 133:23-32; doi:10.1093/brain/awp262 Authors: De Kovel, C. G., et. al.Copy Number Variants of GSTM1 and GSTT1 in relation to lung cancer risk in a prospective cohort study. Ann Epidemiol.2009; 19(8):546-52 Authors: Lam, T.K., et. al.Sample degradation leads to false-positive copy number variation calls in multiplex real-time polymerase chain reaction assays Analytical Biochemistry.2009 Mar 15;386(2):288-90.Authors: Cukier H.N., et. al.Origins and functional impact of copy number variation in the human genome Nature advance online publication 7 October 2009 | doi:10.1038/nature08516; Received 14 August 2009; Accepted 21 September 2009; Published online 7 October 2009 Authors: Conrad D.F., et. al.A recurrent 15q13.3 microdeletion syndrome associated with mental retardation and seizures Nature Genetics.2008 Mar;40(3):322-8.Authors: Sharp A.J., et. al.Recurrent rearrangements of chromosome 1q21.1 and variable pediatric phenotypes The New England Journal of Medicine.2008 Oct 16;359(16):1685-99.Authors: Mefford H.C., et. al.

仅供科研使用,不可用于诊断目的。

* 通用试剂:TaqPath 预混液是在 ISO 13485 认证工厂里生产的通用试剂,标有"仅供实验室使用"。


【本文地址】


今日新闻


推荐新闻


CopyRight 2018-2019 办公设备维修网 版权所有 豫ICP备15022753号-3