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官能团，是决定有机化合物的化学性质的原子或原子团。常见官能团包括羟基、羧基、醚键、醛基、羰基等。有机化学反应主要发生在官能团上，官能团对有机物的性质起决定作用，—X（X为卤原子，对于卤代烃来说，可以认为卤原子是其官能团，但有部分教材认为碳卤键为其官能团）、-OH、-CHO、-COOH、-NO2、-SO3H、-NH2、RCO-，这些官能团就决定了有机物中的卤代烃、醇或酚、醛、羧酸、硝基化合物或亚硝酸酯、磺酸类有机物、胺类、酰胺类的化学性质。 
# Substituents
CC(C)(COP([O-])(=O)OP([O-])(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1OP([O-])([O-])=O)N1C=NC2=C(N)N=CN=C12)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCS* CoA
*C(=O)OCC1C2=CC=CC=C2C2=C1C=CC=C2 Fmoc
CC(C)(C)OC(*)=O Boc
*-N1C2=CC=CC=C2C2=C1C=CC=C2 Car
*C(c1ccccc1)(c1ccccc1)c1ccccc1 Trt
*C(c1ccccc1)c1ccccc1 CHPh2
*C(=O)OCC1=CC=CC=C1 Cbz
*C(=O)c1cc
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