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linux Ubuntu安装及更新升级R教程
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Distributor ID: Ubuntu
Description: Ubuntu 18.04.3 LTS
Release: 18.04
Codename: bionic
目录
安装更新升级走过的坑
安装
今天下午安装了一下午的R，稍微记录一下吧。由于之前都是在window上安装R和Rstudio，傻瓜式next安装即可，由于实验室老服务器之前重装了，一直没有R，正好这两天在帮师兄跑一下svm，加上考虑到以后师弟师妹可能也要用，那就在服务器上安装一下吧。 首先来到R官网链接: link，点击镜像 来到镜像页面后，选择我们国内镜像，例如我选择的清华镜像  接下来，来到我们的linux系统下的 /etc/apt/sources.list，在里面添加清华镜像deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/linux/ubuntu/ bionic-cran35/，需要注意的是，不同的Ubuntu版本 以及不同的R版本是不一样的。这里是 Ubuntu18.04，下载R3.6.3版本。其他版本详细查看链接: readme.  然后，添加进去之后，执行 sudo apt-get update，更新源。然后执行sudo apt-get install r-base r-base-core r-base-dev下载。第一次安装很快成功。输入R，可看到下图 即表示安装成功。输入q()退出R,到这里安装成功了。
更新升级
首先把之前的版本清除干净，remove 会删除软件包而保留软件的配置文件；purge 会同时清除软件包和软件的配置文件
sudo apt-get --purge remove r-base
sudo apt-get --purge remove r-base-core
sudo apt-get --purge remove r-base-dev
并且，之前的R包也需要清理
"/usr/local/lib/R/site-library"
"/usr/lib/R/site-library"
"/usr/lib/R/library"
由于我之前安装的是3.4版本，我现在需要升级为3.6.3版本，那么同样，我需要先进入 /etc/apt/sources.list文件，在里面添加清华镜像deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/linux/ubuntu/ bionic-cran35/. – 如果升级为4.0版本，那么更改为https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/linux/ubuntu/ bionic-cran40/，具体不同版本查看 readme. 然后更新key sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9 sudo apt-get update sudo apt-get install r-base r-base-core r-base-dev 到这里，就成功了。 走过的坑 在这里，我走过的坑是如下 r-base : Depends: r-recommended (= 3.6.2.20200221-1~ubuntu18.04.1~ppa1) but it is not going to be installed这个是因为，source源中的版本和linux系统版本不一致，注意查看，我之前写成了16.04，因为我把linux版本给记错，之前没重装的时候才是16.04. sad~ 另外，还出现这个错误，如果你是执行了，sudo add-apt-repository ppa:marutter/rdev，那么可以试着备份一下cd /etc/apt/sources.list.d的新添加的文件，然后删掉，重新按照我上面的步骤升级更新。 The following packages have unmet dependencies: r-base-core : Depends: libcurl3 (>= 7.28.0) but it is not going to be installed Depends: libpng12-0 (>= 1.2.13-4) but it is not installable Depends: libreadline6 (>= 6.0) but it is not installable E: Unable to correct problems, you have held broken packages. 如果出现这个错误，我认为是你没有删除干净，导致依赖出现了问题，重新按照我上面的更新步骤，删除干净，以及检查你的源版本。如果两个都没问题，检查你的依赖，或者系统依赖退一个版本试试，由于我不是这个问题，正好搜到了这个答案，记录一下参考链接 r-base : Depends: r-base-core (>= 3.6.2-1xenial) but it is not going to be installed Depends: r-recommended (= 3.6.2-1xenial) but it is not going to be installed Recommends: r-base-html but it is not going to be installed E: Unable to correct problems, you have held broken packages. PPA https://blog.csdn.net/u012348774/article/details/80619803参考文章 https://stat.ethz.ch/pipermail/r-sig-debian/2018-July/002926.html https://superuser.com/questions/1422059/pixelbook-installing-r-base-dependency-with-held-broken-packages-error https://ubuntuqa.com/article/6222.html https://www.jianshu.com/p/c7960451f969 |
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