将外用化学制品直接涂抹于疣体。制品有多种形式，如乳膏、凝胶、乳液或溶液。

有些制剂可以由患者自行涂抹，但有些必须由医生涂抹。因为这类药物大多数可以腐蚀正常皮肤，因此当患者在家自行涂药时，必须仔细遵医嘱。通常需要反复涂抹几周到几个月。在疣上涂抹化学药物之前，应首先用热水浸泡疣，以便化学药物更易渗透。不管是在家或在办公室，每次用药前都要刮除坏死的组织。

用于治疗疣的化学药物包括水杨酸、三氯乙酸、5-氟尿嘧啶、斑蝥素、维 A 酸、咪喹莫特、podofilox 溶液、sinecatechins 和鬼臼树脂。其中一些化学药物的作用方式是使疣体周围的皮肤剥脱（剥离）或破坏疣体本身，从而使其松动和脱落。另一些的作用方式则是刺激人体免疫系统来对抗引起疣的病毒。