已有 20482 次阅读 2016-12-1 11:12 |系统分类:科研笔记

在做基因研究的时候，有时苦于寻找其上下游调控基因，TF，miRNA等。数个数据库，N篇文献来回翻，才能辛辛苦苦拼起一张基因调控网络图。

GCBI的调控网络功能，一键就可查实现查看某个基因的调控网络，内容涵盖其上下游调控基因，TF，miRNA，lncRNA。

如想知道CXCL14的调控网络，怎么破？

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搜索CXCL14

基因雷达的展现分为四个维度――科研热度(原全景雷达)、相关疾病（原疾病雷达）、调控网络和表达概况 。

调控网络结果

点击调控网络， 出现如下CXCL14的调控网络，如下图所示，与之相关的基因，TF， lncRNA全都展现在了图中。

界面由三部分组成，图，标识说明和详细列表。

图以和弦图展示，由目的基因发散出与之相关的基因、TF、miRNA和lncRNA，相同种类且具有相同功能的以同种颜色展示，具体可参照左上方的标识说明。

点击图上的圆点，下方会展示详细信息。

若想将去掉一些不关注的点，让调控全景图更聚焦，可直接点击左上方相关的标识说明即可。若想了解更多，可点击右上方的demo查看例子详情。

调控网络基于Pubmed，Mesh，KEGG等数据库，将已经有文献报道，数据挖掘以及数据库中的基因与基因、miRNA、TF、LncRNA的调控关系进行了整理，组成了现有的调控网络。