具体步骤如下：

步骤一 事先准备好测试文档，如下图所示。双击公式，点击菜单栏的大小（size）菜单，选择最后定义（define）项。

步骤二 执行以上操作后，会打开定义对话框，可以调整公式不同位置的字母的大小，同时也可以选择不同的单位进行调整。

步骤三 为了演示调整测试文档公式的字体大小。调整公式字体使其变成二号字体一样大，采用的大小为21pt，如下图所示。

步骤四 最后关闭MathType公式编辑器，调整文档字体为二号字体。

下面给出MathType与Word对应的字体关系，大家可以根据自己的实际需求，调整自己的公式大小。

如需修改word中公式两侧的制表符位，即使用“制表符+公式+制表符+(公式编号)”的形式排版，可以使用样式中的“@正文|独行公式”快速设置样式 

也可以选中公式统一修改制表符位所占的字符数；步骤如下：

1、选中一个mathtype编辑的公式，点击 “开始” 菜单下的 “样式”，如下图：

下一步

下一步，直接输入 制表符所占字符数，根据需要自行调整即可

Reference

如何在office中嵌入MathType

如何在office2016(word2016)中安装mathtype6.9及相关问题解决方案