《黑客帝国》的整部系列影片与其说是一部完整的宗教纪录片，不如换而言之它是一部耶稣成长史。

第一阶段：人体诞生

在影片刚开始的时候，尼奥甚至并没有活在真实的世界中，而是存活在了一个被叫做矩阵的母体世界中。他的人身包括意识都处于睡眠期，而神性则更是根本没有显露出来。

这一段完全可以对比希拉里·普特南的“缸中之脑”实验。即尼奥的身体和意识都存在于了一个虚拟的世界中，他的意识、身体都是被操纵的，都是没有活过来的。

而根据接下来的“红蓝药片实验”，尼奥选择了接受真实，也是选择了作为人体真正的存活。这一阶段是尼奥作为人诞生的阶段，即有人体、有人性，但毫无神识。

第二阶段：神性开启

这个阶段也解决了之前提出的为什么先知否认尼奥是救世主的问题。

因为在尼奥第一次去见先知时，他刚刚从人体中诞生，对周围的一切都完全陌生，神识更是丝毫没有显露出来。所以这个时候，尼奥根本就不是救世主。

尼奥要作为救世主，首先要解决的第一个问题就是人身的毁灭，也就是通常所说的重生。这个情节在第一部的末尾可以见到：史密斯想要杀了尼奥，而且他也真正做到了杀死尼奥。但是尼奥却并没有死，而是复活了，作为一个新的人，或者可以说现在他作为一个带有神性的人复活了。因为他神性的开启，也就开始了他从此开始的奇幻之旅：比如速度快到可以避开子弹；可以飞天；看到数据代码式的真实世界等等。

而在此过程中，也发生了一个特别有意思的情节：尼奥在无意中创造了史密斯这个病毒。史密斯原本作为电脑的程序运算从不会出差错，但是在他杀死尼奥后，尼奥却并没有死。相反的尼奥居然反过头来杀死了自己。这里出现的逻辑错误直接导致了史密斯的系统崩溃。作为影片情节来讲，这里原本只是一个很有意思的小情节。但是它奇特就奇特在，史密斯的病毒体复活实际上是伴随着尼奥的神性打开一同产生的。

这可以直接联系到基督教中一个重要的理论——“原罪”。基督教认为“原罪”是“我们与生俱来的罪，并不是因为我们犯了什么罪才有的”。尼奥从人体中复活，说到底他还是一个有着神识的“人”，所以他的出生才必然带有“原罪”性质。

在这一阶段，尼奥自己也开始意识到自己身上所具有的神性，但是他却并不能承认自己就是神。反应就是他并不接受那个十六岁孩子的追捧以及并不太乐意接受来自民众的供奉。他的身上还存在着很大程度上的人性，体现在他在与史密斯打斗的过程中感觉到了死亡等等。

第三阶段：逐渐过渡

尼奥更进一步靠近他的神性是在他见到架构师之后，他开始意识到这整个世界其实都是假的。但是他的体内仍然存在着人性。

这也就是为什么他在选择是救崔妮蒂还是救整个世界的人类的难题上毫不犹豫的选择了崔妮蒂。首先，崔妮蒂是他的爱人，他在这个时候还能感知爱情，拥有人类的情感。其次，就心理学的存在主义分析，尼奥在这整个世界中都找不到自己的存在感了，他已经找不到自己活着的意义了。这样的意识让他感到恐惧。他需要有爱情，需要有人感觉到他的独特性。其实也是他自己本体防御机制的本能反应。而这也进一步证明了他在此时乃是一个具有人性的人。最后也是最重要的原因，做一个假设：如果尼奥在此刻已经真正成为了一个救世主的形象，那他必然会毫不犹豫选择救世，因为救世就是耶稣存在的根本使命。但是他为什么不选择为世人舍己呢？原因就在于他此时并没有完全成为一个真正意义上的救世主。

接着在尼奥选择了救崔妮蒂之后，尼奥实际上是将已经死去的崔妮蒂重新救活。这不仅反映了圣子起死回生的超能力，也反映出尼奥此时已经与崔妮蒂合为一体，即父子合一。这点将在下文中详述。

再接着，尼奥拥有了在所谓的现实世界中杀死哨兵的能力。因为他已经意识到实际上这个世界也是假的。在知道所有的一切都是假象的时候，他才有能力去操纵所有人的命运。也是进一步神识的打开。在这个阶段，尼奥的神性其实已经开始慢慢地大过于人性了。

第四阶段：基督诞生

尼奥的进一步成长是在他与史密斯在现实中的打斗过后，这时的尼奥被史密斯弄瞎了双眼。史密斯在这里说了一句很有意味的话，“瞎眼的救世主”。但是其实在尼奥眼瞎之前才是真正的眼瞎，因为他看到的世界并不是真实的世界。而在他真正眼瞎之后，他实际上是清醒了，他看到的那个金光闪闪的世界才是真正的世界，所以他才能在此时清晰地看见史密斯的真身。这时的救世主才真正意义上的诞生了。

影片中其实还有一个潜藏的点在说基督的诞生。“尼西亚信经”中有一段话：“主为要拯救我们世人……被害，埋葬，照圣经所说第三日复活，升天，坐在父的右边……”在影片最后，尼奥同崔妮蒂去寻找源头时，尼奥第一次在副驾驶上，在一个很正经的场合里，坐在了崔妮蒂的右手边。而影片中之前的每一次“三位一体”合体，尼奥其实每一次都处在了崔妮蒂的左手边。

同时，在崔妮蒂死时，尼奥虽悲痛却相对意义上来说显得十分的平静。因为此时的他已经真正的成为了一个救世主，一个不再需要上帝的救世主。

第五阶段：基督救世

正因为尼奥成为了真正的救世主，此时的他则完全预备了“为了人民大众舍弃自身”的命定属性。在与史密斯打斗的过程中他由最开始的奋力拼杀到后来的自愿放弃，实际上就是救世主“为了我们的罪”死了的过程。

在尼奥打败史密斯的时候，真实世界中的尼奥宛若被“钉死在十字架上的耶稣”，而他的周身显出一朵盛开的“莲花”，他的背后也显现出一对巨大的“金色翅膀”。这实际上也寓意着死去的耶稣上了天堂。他“上了高天，为人预备天堂。等预备好了，就必再来接我们所有信他得救的人回去，那时我们就可享受永生福乐了”。

影片的最后萨蒂问先知：“我们会再见到尼奥吗？”先知说：“我觉得会。”塞拉夫问她：“你预见了吗？”先知说：“不，我没有。我相信。”

这实际上也是人们对于“基督”必然“复活”的一个信念的显示。

基督教自由主义者认为“离开这个世界的方法是被教化、启蒙”，而在本片中耶稣的成长过程也正是尼奥渐渐接受教化，接受启蒙的过程。

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