黑暗浮士德的真身是孤门一辉的恋人斋田莉子。在奈克瑟斯的故事发生半年前，斋田莉子在动物园与孤门一辉相遇。那天晚上莉子与她的家人一起开车回家，却遭到异生兽诺斯菲尔的袭击。这只异生兽摧毁了他们的车，她的家人也在爆炸中丧生，但此时突然出现了一名夜袭队队员沟吕木真也，沟吕木起初将武器瞄准了诺斯菲尔，却反手转过身朝着毫无戒心的莉子开枪沟吕木你这个gzz。之后她被黑暗梅菲斯特以黑暗力量复活，被沟吕木认为是“他操纵的人偶”，并作为浮士德的容器[5]。莉子在无意识的时候变身成浮士德和奈克瑟斯进行战斗。从那时起莉子和孤门确立了恋人关系。但一直以来莉子都生活在一个被操纵的想象世界里，在那个世界中，她的家人依旧健在。

后来，N之光转移到第二代适能者姬矢准身上。就在准因为昆虫型异生兽拜格巴尊的再次出现而将要变身成奈克瑟斯时，浮士德突然出现在准的面前并攻击他。浮士德声称自己是准的影子，几句交流过后准变身为奈克瑟斯青年形态，并开启了美塔领域，巨大化后的浮士德则用自己的黑暗领域侵蚀覆盖了美塔领域的效果。在这片黑暗领域中，两人展开交锋，似乎势均力敌，直到浮士德使用了黑暗集群，一团黑暗能量球在高空中如雨点般落在了奈克瑟斯身上。奈克瑟斯遭到重创，彩色计时器随之开始闪烁，浮士德不断对其攻击。但奈克瑟斯并没有放弃，在使用了十字风暴之后，浮士德撤出了黑暗领域，并表示“这样才是有意义的战斗，下次再找你玩吧”。

姬矢准在调查花型异生兽莱芙丽雅最近的三名受害者时，浮士德再次现身。为了让准变身成奈克瑟斯与自己战斗，浮士德不断激怒准，被激怒的准变身为奈克瑟斯。两个巨人很快就打了起来，但夜袭队出现后，浮士德就消失了。当奈克瑟斯在美塔领域中与莱芙丽雅交战时，浮士德从地下出现并再次开启黑暗领域。莱芙丽雅和浮士德的合力攻击令奈克瑟斯难以招架，不过在巧妙地使用了粒子之羽后，浮士德很快就被击倒[6]。不过其中一个被浮士德弹开的粒子之羽击中了领域外孤门乘坐的切斯特，将其从天空中击落。

次日清晨，孤门在切斯特中醒来，发现凪从她的座位上消失了。当他出去调查时，他发现他的恋人莉子倒在地上昏迷不醒，她手里拿着凪的狗牌[7]。凪一出现就为此事质问莉子[8]，甚至把孤门打到一边，但受到惊吓的莉子没有回答凪。当晚，莱芙丽雅再次与奈克瑟斯战斗，浮士德又一次出现，战斗中夜袭队使用突击射线击杀了异生兽，浮士德也跟着受到了重创，被迫撤退。大概在这个时候，莉子开始出现幻觉和幻听。她被浮士德和她的主人沟吕木真也折磨，他们抹去了她的记忆，把她变成了一个真正的人偶。

莉子失踪后孤门决定去寻找她，在去莉子家的路上遇到了浮士德，浮士德挡住了孤门的去路。同时回避了他关于莉子的问题，她正打算杀死孤门时准及时出现，并以奈克瑟斯的身份与浮士德战斗。两人再次交锋，但这一次浮士德没有展开黑暗领域，很快就被打败了。撤退后，浮士德正准备与奈克瑟斯进行最后的战斗。孤门和准在森林里发现了莉子的身影，但现在浮士德已经完全控制了她，浮士德在变身前向孤门揭露了莉子身上发生的真相。两个巨人随后在浮士德的黑暗领域中再度交锋，而孤门也被吸进了他们的战斗场地。浮士德站在孤门身边，把他当作人质来殴打奈克瑟斯。奈克瑟斯倒下后，浮士德抓住他，准备将他的光吸收殆尽。

当浮士德开始吸收奈克瑟斯的能量时，孤门为解救奈克瑟斯朝浮士德开枪。孤门的眼神唤醒了莉子的被封闭的记忆，这让幕后观战的沟吕木极为恼火。她松开了奈克瑟斯，并注视着孤门，呼唤他的名字。看不下去的沟吕木真也召唤异生兽诺斯菲尔去杀死孤门，在诺斯菲尔的利爪即将击中孤门时，莉子的意识因为孤门的呼唤恢复，黑暗浮士德为了保护孤门而挺身为他挡住了这一击，被诺斯菲尔的攻击刺穿了后背原本被十字光线·风暴打伤的部位，从而受到致命的重创，莉子变回人形后孤门来到她身边，并一直陪着她直到她死去。在他的怀里，她消散在光的微粒中。