头发里面长痘痘很疼，可能的原因有多种，如毛囊炎、脂溢性皮炎、湿疹、疥疮、皮下血肿等。建议患者无法明确可能原因时不要自行处理，应先就医明确情况。

1、毛囊炎：由细菌感染引起头出现发里面炎症性皮肤疾病，通常表现为红色毛囊性炎症丘疹，并伴有明显的疼痛感。避免用手挤压痘痘，以免发生破裂，如果出现流脓，可以使用碘伏进行消毒。还可就医遵医嘱外用克林霉素磷酸酯凝胶、莫匹罗星软膏等药物进行涂抹治疗。

2、脂溢性皮炎：可能由身体疲劳、情绪紧张、局部感染等因素引发头发里面的部位慢性炎症性皮肤疾病，症状包括局部瘙痒、脱屑、炎症反应等，甚至伴有疼痛感。建议患者就医，在医生指导下口服盐酸左西替利嗪胶囊，外用曲咪新软膏等进行治疗。

3、湿疹：头发里面出现痘痘且疼痛的现象也可能是湿疹引起的，其症状除了出现痘痘之外，还可能会出现红斑、丘疱疹、鳞屑、结痂等情况。在治疗方面，建议患者遵医嘱用药，比如口服马来酸氯苯那敏片，外用阿昔洛韦乳膏等进行治疗。

4、疥疮：由疥螨在皮肤表皮层引起的接触传染性皮肤病，也可能引发这种情况。治疗方法通常包括使用特定的药物，包括复方硫黄乳膏、氧化锌硫软膏等，具体应根据医生的建议进行。

5、皮下血肿：由于头部受到外伤或凝血障碍，局部出现淤血、瘀斑，皮肤隆起可伴有疼痛，可能表现为头发里面长痘痘很疼。外伤后可局部进行冷敷，并在医生指导下使用布洛芬片止痛，还可使用肝素钠注射液改善凝血。

此外，皮脂腺囊肿、血管瘤等也可能有类似情况。无论何种原因导致，都应注意日常护理。要保持作息规律，避免熬夜，饮食要以清淡、易消化为主，避免油腻、辛辣刺激性的食物，多吃新鲜蔬菜和水果，补充维生素。同时，清洗患处时水温不宜过高，避免使用刺激性的洗发水或护发产品。