进化树的构建方法

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进化树的构建方法

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1.在NCBI上搜索所需的目的序列,以Metallothionein(MT)为例。

2.将所需目的序列复制到Word上,形成如图格式。

3.下一步用MEGA7构建进化树。首先打开MEGA,然后点击Align,点击Et/BuildAlignment,然后在弹出的小框中选择Createanewalignment,点击OK,根据你的需求选择Protein或DNA,如果比对的是核酸则点击DNA,若是蛋白质则点Protein.在此以Protein为例。

4.点击Protein,出现如下第一张图所示,然后将目的序列粘贴,变成第二张图所示。

5.点击Date菜单中的PhylogenticAnalysis点击Yes,然后在主菜单中点击Analysis,点击Phylogeny并选择第二个。点击YES,然后在弹出的框中点击compute

6.下图即为所构建的进化树。



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