周口市境属淮河流域，主要有颍河、涡河、淮河、洪河四大水系。颍河水系市内流域面积8856.5平方千米，主要河流有颍河、沙河、贾鲁河、汾泉河、新蔡河、新运河等；涡河水系市内流域面积2781平方千米，主要河流有涡河、尉扶河、铁底河、惠济河等；淮河水系市内流域面积1746平方千米，主要河流有黑河、清水河、洺河、皇姑河等；洪汝河水系市内流域面积81平方千米。100平方千米以上的河流有60条，其中，流域面积在1000平方千米以上的有沙河、颍河、贾鲁河、汾泉河、涡河等15条；500平方千米～1000平方千米的有清水河等7条；100平方千米～500平方千米的有新枯河、晋沟河等38条。

        2015年，根据周口市29个长年雨量站资料统计，全年平均降水量675.3毫米，折算水量69.21亿立方米，较上年减少9.22%。全市水资源总量约21.91亿立方米(扣除重复计算量2.93亿立方米)，较上年减少0.25亿立方米。全市人均水资源量248.7立方米，亩均水资源量170.3立方米(按耕地面积计算)。                                                                                           

        地表水资源。2015年，全市地表水资源量为9.75亿立方米，较上年增加1.70亿立方米。人均地表水资源量110.7立方米，亩均地表水资源量75.8立方米。全市9座大中型水闸年初蓄水量为0.85亿立方米，年末蓄水量为0.80亿立方米，年末较年初减少0.05亿立方米。全市地表水总用水量为2.40亿立方米，占地表水资源总量的24.6%。地表水用水中农业用水量占73.3%，工业用水占10.6%。                                                                                                               

        地下水资源。2015年，全市地下水资源量为15.09亿立方米，较上年减少2.03亿立方米。人均地下水资源量171.3立方米，亩均地下水资源量117.3立方米。全市地下水总开采量为15.15亿立方米，其中浅层地下水开采量为13.72亿立方米，主要用于农田灌溉；深层地下水开采量为1.43亿立方米，主要用于城镇居民生活和工业用水。2015年年底，全市地下水平均埋深4.44米，较上年上升0.36米。2015年年底相比2014年年底，全市地下水埋深上升区（升幅大于0.50米的区域）面积为2120平方千米，占总面积的18.2%，地下水稳定区（变幅为-0.50米～0.5米的区域）面积为4033平方千米，占总面积的34.6%。地下水下降区（降幅大于0.5米的区域）面积为5506平方千米，占总面积的47.2%。