想做Luciferase、点突变、截短、ChIP，不知如何入门，转录因子与promoter结合位点不知道怎么找？看完这篇文章轻松拿下~接下来就是愉快的通过实验验证了！

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基础知识：

启动子（promoter）：与RNA聚合酶结合并能起始mRNA合成的序列。一般选择CDS区上游2 kb。

UTR（Untranslated Regions)：即非翻译区，是信使RNA（mRNA）分子编码区(CDS)两端的非编码片段。

5’-UTR从mRNA起点的甲基化鸟嘌呤核苷酸帽延伸至AUG起始密码子，3’-UTR从编码区末端的终止密码子延伸至多聚A尾巴（Poly-A）的末端。

1. 打开PubMed：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed。

2.选取【Gene】，在旁边输入IL7，点search，按下图示意，根据物种进行选择，我们以人源为案例,点击第二个：

3. 下拉至下图位置，可以看到这个基因的信息：

点Tools，选择Sequence Text View：

还可以看到序列信息：

4. 上面的部分只是该基因的一些信息，可以用来查找相应的UTR等区域，接下来我们进入正题，寻找promoter区域。把网页拉到如下图位置，点击FASTA：

5. 基因位置信息如下图：

6. 一般认为：基因上游2 kb区域为该基因的promoter区域，所以我们将基因上游的2 kb序列调先出来：

复制上述序列，这就是基因的启动子序列了。

3. 得到28条转录因子NFAT与IL17A的结合位点，Strand -1没有特殊意义，选择Strand 1即可。

4. 好了，转录因子与promoter结合位点已经有了，接下来就是愉快的通过实验验证了！Luciferase、点突变、截短、ChIP等统统拉上来就可以了！

本文转载自公众号“U平台”（ID: uptbio）

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