在常规 SDS-PAGE 中，使用 SDS 作为电荷调节剂。SDS 可以附着在蛋白质上并使其变性，让蛋白质带有负电荷；这样可以让蛋白质向正极迁移。SDS 存在于上样缓冲和电泳缓冲液中。NativePAGE Bis-Tris 预制胶则使用考马斯亮蓝 G-250 附着在蛋白质上，使其带有负电荷，同时保持蛋白质的天然状态，不会使其变性。G-250 存在于阴极缓冲液中，为凝胶提供持续的 G-250 供给，在凝胶上样前，G250也会添加于含有非离子型表面活性剂的蛋白样本中。凝胶中不含任何 G-250。该系统是由 Schägger 和 von Jagow 在蓝色非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳（BN PAGE）技术的基础上开发而成，具有近中性的操作 pH 和去垢剂兼容性，突破了传统非变性凝胶电泳的限制。

PVDF 是推荐的印迹膜，可用于与 NativePAGE 预制胶一起进行蛋白印迹。硝酸纤维素膜不适用于 NativePAGE 预制胶的转印，因为硝酸纤维素膜与考马斯 G-250 染料结合得非常紧密，并且与用于脱色和固定蛋白质的含酒精溶液不兼容。

G-250 与蛋白质的结合具有以下优势，可实现高分辨率的天然凝胶电泳（Schägger，2001年）：