新型冠状病毒的变异是指在原有病毒的基因组基础上发生了某一个基因碱基的突变，或者某些碱基的缺失。碱基的突变又可以发生同义的突变和非同义的突变，同义的突变一般不会发生氨基酸的改变，表达的蛋白一般不会有变化，这样对于改变病毒的性质没有太大的意义；而非同义的突变可以引起氨基酸的改变，表达的蛋白会发生改变，这样对于改变病毒的性质意义重大。对于发生上述的突变或者碱基的缺失，可以导致病毒的性质变化，病毒可能会出现比如传染性、宿主范围、传播力度、毒力、致病力、病情的严重程度、预后以及免疫源性的改变。这样就会导致临床整个发病过程以及流行病学发生变化，甚至对于免疫源性以及免疫的预防也可能会出现影响。