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通过对出土古DNA与现代人全基因组SNP的分析，目前一般认为，美洲原住民全基因组三分之二的祖源更接近现代东亚人，而三分之一接近现代西部欧亚人群，尤其是北欧人。

对此结果更近一步的解释是：非洲外现代人的共同祖先群体在首先与尼安德特人发生混合后（猜测发生混合的地点是近东），逐渐分化为东、西两部分群体，东部群体进一步分化为现代东亚人的奠基群体和现代澳大利亚、新几内亚人的奠基群体。西部群体分化为古北西伯利亚群体（Ancient North Siberians）和早期欧洲狩猎采集群体（European Hunter-Gatherer）。古北西伯利亚群体之后一部分西迁与早期欧洲狩猎采集群体混合，一部分留在西伯利亚，与北迁的东亚奠基群体发生混合，形成古古西伯利亚群体（Ancient Paleosiberians）。古古西伯利亚群体中东亚与古北西伯利亚成分比例大致为2:1，古古西伯利亚群体一部分向东越过白令海峡，形成今天美洲原住民占绝对主导地位的祖源，另一部分与大批的来自东亚群体的移民再次发生混合，形成新西伯利亚群体（Neosiberians），是现代西伯利亚原住民的主要奠基群体。古北西伯利亚群体的存在由约2.5万年前的、出土于俄罗斯马里塔（Мальта）的12岁男孩遗骸所具有的DNA所证实。

另外，除了以上欧亚大陆各群体之外，还存在旁系欧亚群体（Basal Eurasians），该群体与以上所有群体共同祖先的分化年代甚至早于与尼安德特人混合的年代，因而被称为“旁系/基部”，同时因此该群体并不携带尼安德特人祖源。但同时，旁系欧亚群体与其他欧亚群体享有与非洲所有群体相比年代更近的共祖。旁系欧亚群体组成了一万年以前近东几个分离很远的子群体的主体祖源，这一祖源成分随着近东狩猎采集者转变为农民并发生大规模混合后（在农业发展及伴随的近东人群混合发生之前，近东、欧洲不同人群间的遗传距离都与现代西欧人与东亚人的遗传距离大致相当），在一万年左右向欧洲进行大规模移民与农业传播中扩展开来。这一次大规模移民，再加上具有显著古北西伯利亚成分的、使用原始印欧语的干草原群体（The Steppe）从中亚与东欧向西（至西欧）、向南（至印度）的大规模扩展，基本塑造了现代的欧洲人群。

同时，传统体质人类学上典型的所谓“高加索”特征，例如金发、蓝眼、浅肤色，其实也是由于以上混合所带来的结果，而非“纯粹”特征。对古DNA的分析显示，一万年前的近东农民的体质特征是黑发、褐眼、浅肤色，生活在西欧的欧洲狩猎采集者是黑发、蓝眼、深肤色，而金发则是由古北西伯利亚人群西迁才引进欧洲的体质特征。反过来，单纯凭借现代美洲原住民和东亚人的黑发、褐眼并不能够说明两个群体享有更近的共祖，通过以上全基因组、古DNA的分析才能得到相对全面的结论。