ImageJ划痕实验分析

2024-07-16 21:47| 来源: 网络整理| 查看: 265

PAGA轨迹分析报错问题

黍离悲: 第三个错可以试试把adata.X改成adata.X.todense()

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Beautiful_Sunny: 是不是还没完结

服务器安装 scenic plus python包

sungriez: 老哥scenicplus的流程跑通了吗？我这边macs2 callpeak总是出问题，运行： narrow_peaks_dict = peak_calling(macs_path, bed_paths, os.path.join(work_dir, 'scATAC/consensus_peak_calling/MACS/'), genome_size='hs', n_cpu=8, input_format='BEDPE', shift=73, ext_size=146, ignore_reinit_error=True, keep_dup = 'all', q_value = 0.05, _temp_dir = os.path.join(tmp_dir, 'ray_spill')) 报错： return with error (code 127): b'/bin/sh: 1: macs2: not found\n' 但是在bash中运行macs2是OK的

numba 报错 SystemError: initialization of _internal failed without raising an exception

javaaaaaaaaa: 感谢解决了，直接指定就行了

构建绵羊（非常见物种）BSgenome参考基因组

鲜衣怒马: BSgenome可以创建人和病毒融合的参考基因组嘛

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