FT-IR成像和红外激光成像普遍适用于一切需要观察样品中化合物分布情况的应用，例如，需要检查产品是否均匀或是否存在污染的工业应用。

在制药行业，检查产品的均匀性尤为重要。各种片剂形式的药物应当达到完全均匀，以消除活性成分的“热点”。毕竟，许多药片可以掰成两半来拆分剂量，因此，如果活性成分只存在于药片的某一半，则会出现问题。红外成像可快速扫描整个药品，并且通过化学图像可轻松地观察活性成分的分布情况，以确保其分布均匀。 在许多行业中，检查成品是否有污染是质量控制的一个重要方面。红外成像在这一应用中具有优势，因为它能够快速扫描大型工件。例如，使用FPA探测器，只需几分钟即可对半导体行业生产的大硅片进行成像，以便查看硅片中是否有杂质。即使在硅片上焊接了电子器件之后，仍可以使用红外显微镜，对芯片难以触及的区域进行故障分析。 除了这些标准的质量控制和故障分析应用之外，在其他许多领域——从物证鉴定到古生物学，从文保修复到医学，通过创建高精度的化学图像来直观呈现和表征样品的结构都是非常有用的。  红外成像的一个特别令人兴奋的应用是组织成像，尤其是使用红外激光器进行组织成像。使用FPA探测器，只需几分钟即可对组织样本的大切片进行成像。这些图像能清晰地显示碳水化合物、蛋白质和脂质在该组织中的分布。在医学领域，此方法非常有用，因为它可以快速筛查患者组织样本中的病灶或癌细胞。相比于其他方法，红外成像能够更快地完成组织筛查，从而有望显著加快病灶和癌症检测过程，更及时地为患者提供治疗方案。