Linux系统与shell教程(1)：有没有兴趣玩耍一下shell版俄罗斯方块？ |
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Linux系统与shell教程(1)：有没有兴趣玩耍一下shell版俄罗斯方块？
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来，我要诱惑你Linux系统与shell安装属于你的Linux系统shell的功能shell特点shell版本
shell初体验Hello Shellshell版俄罗斯方块
怎么学shell参考
作者：余涛
email：[email protected]
中国科学院大学
来，我要诱惑你
想要入门生信吗？ 想要学习Linux系统吗？ 想要花最少的时间学会一门编程语言？ 想要写一个shell版俄罗斯方块？ 想要把生信分析流程（WES、RNA-Seq、Chip-Seq、Metagenomics-Seq…）捆成一个软件，批量运行？ … 来吧，学点shell！ 温馨提醒：由于阅读人群基础不一，这里默认面向零基础的群体，因此有很多啰嗦的话，老司机们请自行跳过某些部分。(毕竟，在这个知识爆炸的时代，浪费别人的时间实在是不道德的事） Linux系统与shell在互联网+的时代，无论是开发端游、手游、操作系统的程序猿，还是做大数据分析、人工智能的工程师，更或者是像我们这种苦逼的生信猿，无一例外都要用到Linux操作系统。这个由被称为“大鼻子男孩”Linus Torvalds在1991年开发的类Unix操作系统，现在已经成了除微软以外应用最广的的操作系统，尤其是一些大公司，甚至连微软自己都用。 另外一个你想不到的是，我们所有Android系统手机也是基于Linux系统的。Linux系统自创建以来就以开源（open source）为宗旨，现在已经有很多发行版本，例如像CentOS、Ubuntu、Debian等，每个版本一般都有桌面版本和服务器版本。Linux系统与Windows系统差别最大的一点是它以命令行模式为主，美国大片里各种狂拽酷炫屌炸天的黑客攻击的镜头，就是在Linux系统上干的。 每个人都可以轻松拥有一个Linux操作系统（当然前提是你得有电脑），如果你是苹果电脑，直接打开shell程序即可进入命令行模式，因为苹果电脑本身就是Unix系统；如果不是，推荐在Windows 系统上安装虚拟机，好用的虚拟机软件例如VirtualBox、VMware,安装方法如同安装QQ、微信一样，具体的过程可以参考兄弟连Linux视频教程 shell的功能无论哪个发行版本，Linux操作系统的核心原理都是基于shell实现外层应用程序和内核以及硬件的通信，从而实现人对机器的控制。 可见shell的初衷是帮助用户和管理员更好的维护和管理操作系统，但其实shell对于通常的文本处理（例如某些表格、系统运维日志），甚至是某些数值运算都是友好的。因此，学好shell既能帮助你把Linux系统玩得很溜，又能帮助你快速、便捷地处理一些简单或者复杂的编程项目，一举两得，何乐而不为呢？总结shell的主要功能： Linux系统管理和运维：例如批量增加/删除多个用户文本处理数值运算整合其他软件/语言，搭建流程shell作为一门语言，也如java、perl、python等语言拥有不同的版本。不同的shell版本，基本功能、语法大致相同，但有些语法细节、命令参数使用会因版本有小的差异，在学习的时候需要注意。否则，在多个版本的切换中，你的shell脚本可能暗藏一些bug。 常见的shell版本 sh:即Bourne shell，是最基础的shell。bash :Bourne-Again SHell，在sh的基础上增加了一些特性，最常用的shell，后面都以它为例讲解。bash可以完全兼容sh,也就是说用sh语法的脚本不加修改可以在bash中执行，反过来却不行，bash的脚本在sh上运行容易报语法错误。这一点一定要注意。csh(C shell):类C的语法tcsh:csh的增强版zsh:Mac系统上超级增强版shell，被称为“终极shell”功能更强大，但配置什么也更复杂。zsh在github上star已经快90k了，fork也快17k了，如果有大神想用，请移步zsh github。查看你系统默认用shell版本以及安装的所有shell版本 echo $SHELL #echo命令用于输出、打印，在脚本调试时很有用 /bin/bash #可见我系统默认shell是bash cat /etc/shells #cat用于查看文本 /bin/sh #可见我系统自带4种shell /bin/bash /bin/tcsh /bin/csh shell初体验 Hello Shell按照惯例，我们在非交互模式下写一个学习每一门语言都会写的第一个脚本–打印Hello Shell(交互模式下直接在命令行提示符键入echo “Hello Shell!”）。 [Neptuneyt]$ vi helloShell.sh #用vi/vim新建一个名为helloShell.sh的脚本,vi （vim）是linux系统一个强大的文本编辑器 #！/bin/bash echo "Hello Shell!" #按i输入左边内容，esc+shift+:+x保存退出 [Neptuneyt]$ bash helloShell.sh #执行脚本 Hello Shell! shell版俄罗斯方块为了增加大家的学习兴趣，特地找了一个俄罗斯方块游戏的shell脚本，希望大家在看了本系列教程后，也能看懂这个脚本如何work的，或者至少能写出一个生信流程。 （将Tetris.sh里的shell源码复制到你的Linux系统，$提示符后键入bash Tetris.sh 现在开启童年模式，愉快的去玩耍俄罗斯方块吧！） 如果说编程就是搭积木游戏，你可以参考下面的套路： 知道每一块积木的用途 对于shell来说，你需要尽可能熟悉Linux系统命令，常用的可能20多个，例如grep、sed、awk等。遵守积木搭建的游戏规则 其实就是语法，包括变量和流程控制。不同变量存储不同类型的数据（字符串、数值、数组等），流程控制决定整体运行方向（循环或者判断分支）。变量怎么命名？循环是什么结构？优化搭好积木的结构 结构上是不是能精简？代码是不是能复用（函数）？循环时间是不是能压缩。。。搭一万次积木 神枪手都是子弹喂出来的，程序猿也是，结合实际需求，多练多写才是王道。（当然，某些天才是例外，人生来是为了创造语言的）本次shell教程的讲解和源码在Github Shell-10-Lessons,欢迎大家star、fork、watch！ 参考Shell script wikipedia Shell Scripting Tutorial |
当然，万丈高楼平地起，我会从Linux系统、常用命令和shell语法等基础讲起。废话不多说，首先看看什么是shell？shell能干嘛？学会shell你要付出多少时间？
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