虽然日本佛教流派繁多，但是大多数为镰仓佛教系的净土宗（中国和日本都有的宗派）和日莲宗（日本独有的宗派）派系，以大乘佛教（不仅渡自己还要渡众生）为主。因为净土宗的衍生派系“净土真宗”（日本独有的宗派）和日莲宗比较著名，所以中国国内有观点认为日本的佛教并非正宗佛教，然而其实中国的佛教早在南北朝梁朝时代经梁武帝改革以后也与印度原始佛教有很多区别（比如原始印度的佛教并不是严格吃素而是“众生平等”，化缘化到什么吃什么，释迦牟尼佛祖本尊也是如此），而且本来成佛的法门就不拘泥于所谓正宗的概念。

日本佛教界传统认为日本佛教共分为13 宗56 派，而按照1940 年日本宗教团体法的分类体系，日本的佛教分为28 宗派，虽然现代日本不断涌现出新的宗派和佛教风格的新宗教，比如当今日本势力较大的法华经系新宗教创价学会、立正佼成会等，但是本文仅介绍日本传统佛教的“十三宗”，这13 宗为：华严宗、法相宗、律宗、真言宗、天台宗、日莲宗、净土宗、净土真宗、融通念佛宗、时宗、曹洞宗、临济宗、黄檗宗。

华严宗：与中国的华严宗相似，以《大方广佛华严经》为核心思想的佛教宗派，将全宇宙视为毗卢遮那佛的显现，说法界缘起，无尽缘起，一即一切、一切即一等思想的宗派。日本开山祖师为审祥，本山为奈良东大寺。

法相宗：与中国的法相宗（唐玄奘就是这一宗派的著名代表）相似，以《解深密经》、《瑜伽师地论》、《成唯识论》为核心思想的宗派，将唯识说奉为核心思想，即“一切唯识所现”（崇尚纯粹的精神作用）。日本的开山祖师为道昭，本山是奈良兴福寺、药师寺，著名的京都清水寺也属于这一宗派的衍生派系。

律宗：与中国的律宗相似，以《十诵律》、《四分律》为主要戒律，开山祖师为著名的鉴真和尚，本山是著名的奈良唐招提寺。

真言宗：又称“东密”相传为唐朝密宗青龙寺惠果大师真传，以《大日经》、《金刚顶经》为核心思想，教义理论主要为通过六大缘起、曼荼罗、三密等修行从而即身成佛。开山祖师为著名的空海（弘法大师），本山众多，主要有京都东寺、高野山金刚峰寺、醍醐寺、智积院、长谷寺、根来寺。

天台宗：与“东密”相对，又称“台密”，源于中国的天台宗，但是在日本与密宗结合发展成显密结合更倾向于密宗的宗派。以《妙法莲华经》为核心思想，说五时八教，通过观法迅速成佛的思想。开山祖师为著名的最澄（传教大师），本山为著名的京都府比叡山延历寺（就是曾经被织田信长烧毁的那座日本中世的佛教中心，现存建筑主要为江户时代以及以后陆续重建的）。

日莲宗：日本独有的宗派，又称“法华宗”，顾名思义该宗奉《妙法莲华经》为经典，且特别重视诵念“南无妙法莲华经”这一经名，认为称颂该经的名字即是皈依法华经。与同样信奉法华经的天台宗不同，该宗奉《法华经》为唯一的正法、超越时空的绝对真理，甚至认为“真言亡国、禅天魔、念佛无间、律国贼”——全面否定其他宗派的思想，认为法华经才是末法时代拯救终生的唯一法门。甚至认为天皇也不能违背佛法，否则将受到佛罚，从宗教角度否定天皇的权威。开山祖师为日莲（立正大师），总本山为山梨县身延山久远寺。

净土宗：源自中国，奉净土三部经——《佛说无量寿经》《佛说观无量寿经》《佛说阿弥陀经》为经典，以一心称念阿弥陀佛名号为主要修行法。净土宗又分为西山三派——西山净土宗、西山禅林寺派、西山深草派，开山祖师为法然，总本山为京都知恩院，西山三派的本山分别为光明寺、禅林寺、誓愿寺。

净土真宗：日本独有的宗派，又名“一向宗”。虽然源自净土宗，但是脱离了佛教无神论、多元化偶像的特点，变为一种极端的信仰阿弥陀佛的一神教型宗教，这一特点类似基督教。提倡“他力本愿”（依靠阿弥陀佛的本愿即可成佛）、“恶人正机说”（以佛的视角所有人都是恶人，但是恶人也可以成佛）。该宗派与其他宗派最大的区别在于不持戒，可以吃肉娶妻，在明治维新以前可以公开结婚的只有这一宗。开山祖师为亲鸾，总本山曾经是石山本愿寺（今大阪），战国时代曾经组织类似太平天国的农民起义“一向一揆”运动，一度被织田信长讨灭，战国后期至江户时代被德川家康分裂为东、西本愿寺（都在京都）。

融通念佛宗：日本独有的宗派，源自净土宗，以《华严经》、《法华经》为核心思想，净土三部经为辅助思想的宗派，信奉“一人念佛既是万人念佛”的理念，甚至有一边跳舞一边念佛的习俗，开山祖师是本为天台宗的良忍，本山是大阪大念佛寺。

时宗：日本独有的宗派，源自净土宗，与净土宗不同的是，净土宗讲究首先要信佛再念佛才可以往生极乐，但是时宗主张不论是否信佛，只要念佛即可往生极乐，信奉佛的本愿力至高无上的理念，甚至可以影响不信佛的人，与圆通念佛宗一样，也有一边跳舞一边念佛的习俗，开山祖师为一遍，本山是清净光寺。

曹洞宗：源自中国，坚持“正统佛法”，奉南无释迦摩尼佛为本尊，讲究以“即心是佛”之心坐禅悟道。基于“修证一如”的理念坚持“只管打坐”。开山祖师为曾经留学宋朝禅寺的道元（承阳大师），本山为永平寺、总持寺。

临济宗：源自中国，以开悟为目的，认为众生本来皆有佛性，佛性是超越了语言理解范围的认知能力，以坐禅、公案等方式修行悟道，在日本通过诗歌、绘画、建筑等形式展现悟道。开山祖师为曾经留学宋朝禅寺的荣西（千光国师），本山为建仁寺、圆觉寺、妙心寺、东福寺。

黄檗宗：源自中国，本属于临济宗，基本同临济宗的禅修法，特点是明代的念佛禅修法，开山祖师是明末清初来自中国福建的禅师隐元（真空大师），本山是黄檗山万福寺（这是一座日本稀有的明式寺院）。

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