中山大学李文均团队揭示自然环境下病毒群落辅助代谢基因组成的影响因素

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中山大学李文均团队揭示自然环境下病毒群落辅助代谢基因组成的影响因素

2022-12-05 14:41| 来源: 网络整理| 查看: 265

  研究发现,病毒的生活方式是影响AMG组成的最重要的驱动因素,其次是生境和宿主种类。具体而言,不管在什么生境中,与温和型病毒群落相比,裂解型病毒群落编码的AMGs都具有更高的多样性。同时,裂解型病毒倾向于编码可以促进病毒后代繁殖的AMGs,如与伴侣蛋白合成、信号蛋白和脂质代谢相关的基因。而温和型病毒则倾向于编码有利于提高宿主生存能力的AMGs,如原核生物防御系统、双组分系统和致病基因等(图1)。该结果在全球海洋病毒数据集(GOV 2.0)中得到进一步验证。此外,裂解型和温和型病毒群落倾向于通过 AMGs 以不同的途径介导微生物驱动的生物地球化学循环,尤其是氮循环(图2)。这些现象可能与不同生活方式的病毒具有不同的进化背景有关。当聚焦于特定生活方式的病毒时,研究发现裂解型病毒和温和型病毒编码的AMGs均具有明显的生境依赖性和宿主特异性(图3, 4)。



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