毛状白斑通常无症状，不需特异性治疗。但毛状白斑往往不是一个单独的症状出现，而是伴随着其他症状同时出现，故对此治疗是综合性的。

目前对毛状白斑的治疗主要使用针对人类疱疹病毒有效的药物，可用阿昔洛韦和更昔洛韦治疗。停药后易复发，复发后再次使用仍然有效。另外，采用高效抗艾滋病病毒治疗后，毛状白斑基本也可消失，可使用齐多夫定抗艾滋病病毒治疗。

针对念珠菌等真菌感染，可用制霉菌素或酮康唑治疗。

可采用骨髓移植、淋巴细胞疗法、使用白细胞介素Ⅱ等提高免疫。

维甲酸类药物具有促进上皮细胞生长与分化，使上皮角化异常恢复正常的功能。

必要时毛状白斑可手术切除并送去进行活检，进一步确诊。

对患者进行退热、镇静、心理治疗、营养疗法等。