在临床上并没有基因不合这个说法，但是如果夫妻双方或其中一方有基因方面的问题，如染色体存在异常，则可能会影响生孩子，或出现流产的几率增高。

在基因检测中，如果发现有女方基因突变，或发现男方有导致精子生成的基因突变，此时会影响生孩子，可能会导致孩子畸形。此外，如果在基因检测中，发现一些常见的隐性基因病携带，如X连锁隐性遗传疾病，如果夫妻双方都携带此类基因，则患者子代可能会有25%的概率，会出现相同的临床表型。针对此类患者，不宜通过自然妊娠要孩子。

但对于有遗传相关缺陷的患者，可以通过三代试管技术，筛选到基因表现正常的胚胎，能够要一个健康的孩子。因此，在基因检测的过程中，如果发现可能存在的遗传基因病，通常不要过于担心。建议夫妻双方在要孩子前，进行详细的遗传学检查，避免后代出现遗传缺陷的风险。