临床主要用于治疗小儿腹泻、厌食，以及成人慢性胃炎、白细胞减少等病症。

1.小儿泄泻：六神散加味六神散治疗小儿脾虚泻80例，以大便、食欲、精神变化评价疗效，1个月为1个疗程。结果：治愈72例，好转8例，总有效率100%。(《河南医药信息》1994年第3期)

2.小儿厌食症：六神散治疗脾阴不足型小儿厌食症31例，以食量、大便变化评价疗效，3～7日为1个疗程。结果：显效22例，有效8例，无效1例，总有效率96%。(《陕西中医杂志》2009年第11期)

3.慢性胃炎：六神散治疗慢性胃炎68例(治疗组)，对照组给予西药(奥美拉唑、甲硝唑以及阿莫西林)常规治疗，以上中腹部症状、体征变化评价疗效，14日为1个疗程，连用2个疗程。结果：治疗组痊愈63例，显效2例，有效1例，无效2例，整体有效率97.1%。(《中外医学研究》2011年第22期)

4.白细胞减少症：六神散治疗化疗后白细胞减少症50例，以白细胞数及分类恢复、持续情况评价疗效，4周为1个疗程。结果：显效26例，有效19例，无效5例，总有效率90%。(《江苏中医药》2002年第10期)