土壤微生物多样性是影响地下生态系统结构和功能的关键因素之一；然而，对微生物多样性对多种全球变化因素的反应知之甚少。在此，我们根据从237篇发表的论文中收集的数据进行了全Meta分析，探讨了多种全球变化因素（二氧化碳升高（eCO2）、气候变暖、氮增加（eN）、干湿循环、干旱、降水减少（降水（-））和降水增加（降水（+））对不同生态系统（耕地、草地、森林、灌木丛、沙漠、湿地和苔原）微生物多样性（Shannon指数）的影响。全球变化使土壤细菌和真菌多样性分别平均减少2.9%和3.5%。对于每个全球变化因素，降水（-）、eN、干湿循环和干旱对土壤微生物多样性的影响大小为负，而eCO2、变暖和降水（+）的影响大小为正。这一现象是由年平均温度（MAT）和土壤环境因素（特别是土壤pH值、体积密度和有机碳含量）的变化驱动，而不是年平均降水量。此外，土壤微生物多样性的效应大小随着MAT的增加而线性下降，这表明微生物多样性在全球范围内高度依赖于气候条件。此外，全球变化因素的双向和三向交互作用加剧了单个效应的负面影响。我们建议，必须进行长期的、多因素的实验来评估土壤微生物多样性对全球变化的反应，因为多种全球变化因素往往同时发生。