乙醇沉淀DNA和异丙醇沉淀DNA的区别 |
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乙醇沉淀 dna 和异丙醇沉淀 dna 的区别
异丙醇和酒精都是有机溶剂,一般来讲,提取质粒的时候一开始都要用异丙醇沉淀,因为 异丙醇沉淀的效果要好一些,但最后大多用酒精沉淀,因为酒精容易挥发,对下游的实验 影响小
异丙醇比较疏水,能很更好地沉淀核酸,用乙醇的目的是去盐,它比异丙醇更亲水, 所以能去掉一些盐离子。
有时还用 70% 的乙醇洗样品也是为了增加盐的溶解度。
在沉淀核酸时可用乙醇与异丙醇,乙醇的极性要强于异丙醇,所以一般用 2 倍体积乙醇沉 淀,但在多糖、蛋白含量高时,用异丙醇沉淀可部分克服这种污染,尤其用异丙醇在室温 下沉淀对摆脱多糖、杂蛋白污染更为有效。
异丙醇沉淀核酸时,高浓度盐存在将使大量多糖存在在溶液中,从而可达到去多糖的 作用。但高浓度的盐存在会影响核酸的进一步操作,因此必须用乙醇多次洗涤脱盐。
异丙醇:
优点:所需容积小且速度快,适用于浓度低,而体积大 DNA 样品的沉淀。 0.54~1.0 倍 体积的异丙醇可选择性沉淀 DNA 和大分子 rRNA 和 mRNA ; 但对 5sRNA 、 tRNA 和多糖产物不产 生沉淀,一般不需要在低温条件下长时间放置。
缺点:易使盐类(如 NaCl 、蔗糖)与 DNA 共沉淀;在 DNA 沉淀中异丙醇难以挥发除去, 所以常规需要用 70 %的乙醇漂洗 DNA 沉淀数次。
乙醇:
沉淀 DNA 乙醇是首选的有机溶剂,对盐类沉淀少, DNA 沉淀中所含的衡量乙醇易蒸 发去处, 不影响以后的实验。 在适当的盐浓度下, 2 倍样品容积的 95 %乙醇可有效沉淀 DNA , 对于 RNA 则需要将乙醇量增加至 2.5 倍 .
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