吴茱萸的用量在不同的方药中剂量也不相同，一般最大剂量不超过10克，具体用量需根据通过医生辨证而定。吴茱萸性热，味辛、苦，有小毒，归肝、脾、胃、肾经，具有散寒止痛、降逆止呕、助阳止泻等功效。常用吴茱萸汤驱散中焦寒气，治疗寒郁类疾病，吴茱萸味辛苦而性热，能温胃祛寒，常用吴茱萸配伍黄连来治疗疾病。吴茱萸通常最多为10克，比如吴萸连苏饮，方中吴茱萸2克，治疗寒凝胃腑兼有肝胃郁热、寒热错杂型的胃痛；吴茱萸汤治疗寒凝厥阴阳明、阴寒上逆的头痛和偏头，方中吴茱萸为2克。常用吴茱萸治疗脾肾阳虚、五更泄泻，多与补骨脂、肉豆蔻、五味子等同用，如四神丸亦常以外治法用于虚火上炎之口舌生疮、咽喉肿痛，其中制吴茱萸，可以散脾肾之寒，以暖土止泻，吴茱萸为5克。