湖泊萎缩退化的原因有多种,除自然因素外,围垦造田、养殖以及填湖造房、修路等人类活动也是加速湖泊萎缩退化的推手。可采用以下方法防止湖泊萎缩退化

(1)推进河湖水系连通,增强水资源配置能力。以水库为调蓄中枢,以河道、渠系为主要输水载体,连通河流水系与沿途湖泊、水库实行调水引流、多源互补、丰枯调剂、以清释污,构建引得进、蓄得住排得出、可调控的江河湖库水网体系

(2)抓好水域岸线管理,促进水生态系统修复。制定湖泊流域开发和保护的控制性指标,合理确定主要湖泊的生态用水标准,加强水利水电工程生态环境影响评估论证,保持河湖的合理流量和水位推进重点江河湖库综合整治,促进水生态系统修复

(3)构建合理的湖泊保护管理体制。管理要落实到沿湖各级政府。建议将保护湖泊的完整性与地方政府工作考核挂钩,有效杜绝些地方政府纵容甚至参与填围湖泊。可推广太湖无锡实行的“河长制”。在很多地方,责任不明是制约河湖萎缩退化和污染治理的一个重要因素。