主角（日文︰主人公，英文︰Main Character）是指遊戲中由玩家控制的角色，或者说玩家在游戏中的化身。与之相对的角色是NPC。

主角都是一位十多岁的宝可梦训练家，受宝可梦博士的完成寶可夢圖鑑之托，拿到了最初的伙伴从而踏上旅途。途中往往还要阻止邪恶组织，最终称霸寶可夢联盟从而登入名人堂。

第一世代的主角年龄為11歲，《黑／白》為14歲（最初設定為16歲），《歐米加紅寶石／阿爾法藍寶石》為12歲。《太陽／月亮／究極之日／究極之月》中主角的年龄尚不明确，但根据诸岛巡礼的要求可知年龄在11岁与19岁之间。在第四世代中，图鉴追加了身高体重比的功能，可以借此得知主角的身高体重。

官方網站的角色介紹没有出现过主角的名字，男女主角分别被称为少年（日文︰男の子，英文︰Hero）和少女（日文︰女の子，英文︰Heroine）。在遊戲宣传片内，显示主角名字的地方通常會使用對應遊戲版本相关的名稱。《太陽／月亮》起，演示多人内容时除了游戏版本名称之外也會采用其他名字。主角的名字可以在游戏刚开始的时候由玩家自由决定。《火紅／葉綠》之前，遊戲还会提供几个備选名字供玩家选择。从《火紅／葉綠》至《心金／魂銀》，如果名稱輸入為空白，遊戲會從備選名單中选择一个備选名字供玩家确认。《黑／白》起，游戏不再提供備选名字。

由于基本没有台词，《寶可夢》系列中基本上看不出来主角的性格，但是在Pokémon Masters EX等旁支系列游戏中登场的《寶可夢》系列主角都有鲜明的性格。最开始只能扮演男性主角，从《水晶版》开始可以选择女性主角。根据主角性别不同，某些NPC对话会有些许不同。部分游戏中，未被选择的另一个性别的主角会成为NPC登场。

在第六世代起，主角能够在一些游戏中选择肤色、更换服装和改变外貌。在《传说 阿尔宙斯》中，主角有了更多的游戏机制。

《寶可夢》系列中，在第一世代和《金／銀》中只能选择男性主角。从《水晶版》开始，可以选择女性主角。主角的外貌在第一至第五世代，以及《歐米加紅寶石／阿爾法藍寶石》中是始终不可改变的；而自《Ｘ／Ｙ》起，可以在首次进入游戏时选择主角的外貌，包括肤色、对应的发色以及一套默认的服装。可以在相关店铺改变主角的发型和服饰等形象。

《Ｘ／Ｙ》中，需要选择主角的性别之后才可以选择外貌，且男女主角分为两个画面，自第七世代起二元性别化的提示被淡化，说明文字中并无提及“性别”，而以“外貌”“样子”等词语代替，原本的男女主角的外貌也被放在了同一画面内，而《朱／紫》中男女主角的性别差异也变得不明显，且服装、面部妆容和发型不再区分性别。

旁支系列游戏中主角的目标各有不同，也不一定是宝可梦训练家，有些主角甚至是寶可夢。

《竞技场》、《竞技场2》和《竞技场金银》的主角只被称为训练家（日文︰トレーナー，英文︰TRAINER）。用《竞技场金银》和《水晶版》联动的话，可以使用女主角。

除了《寶可夢巡護員 風湧篇》之外，未被選擇的主角也會作为NPC登场。

玩家可以用记忆钥匙创建一个化身，有5种风格类型。

《跳躍吧！鯉魚王》的主角只被稱為培育家（日文︰プレイヤー，英文︰You）。《寶可夢頻道》的主角未露面，默认名字為觀樹（暂译，日文︰ミキ，英文︰Seth）。《宝可梦野营》的主角未露面，被稱為野营者（暂译，英文︰Camper）。

此两作小拉达是第一只宝可梦，大乱战SP玩家控制被称为为冒险者的训练家（仅有mii版统一背影）。

此两作皮卡丘是第一只宝可梦，大家的宝可梦大乱战中玩家的mii形象会作为训练家出现。

在动画中，小智是最核心的主角，动画以小智的旅行历程为主线。除此之外每个系列小智都会有几个同伴与他一起旅行，他们也是主角，但在随着旅行进行中会加入和离开队伍，并不会像小智那样贯穿整个系列。

莉可和罗伊是寶可夢 地平線的主角。

动画中也会有遊戲中的主角登场：例如小智和阿弘就是以游戏中的赤红为蓝本设计的；小遥在寶可夢 超世代中登场；小光在寶可夢 鑽石＆珍珠中登场；莎莉娜在宝可梦 XY中登场。

瑪莉娜和健太则在外传动画雷公 雷的传说中登场，他们与火箭队对抗并保护传说的宝可梦。他们二人是以克丽丝和阿响（第二世代版本）为蓝本设计的。

琴音在城都特展！菊草叶与小锯鳄登场!!中登场。另外小智一行人还和宝可梦巡护员的主角日向、创一和夏也是好友。

而小悠、明辉和阿响等主角也曾在宝可梦电影开场的时候出现。

动画中除了人类之外，一些寶可夢有着大量戏份，如小智的皮卡丘、小霞的波克比、小光的波加曼、艾莉丝的牙牙、希特隆的咚咚鼠、火箭队的喵喵、武藏的果然翁。不同于其他宝可梦，这些宝可梦基本上甚至完全不呆在精靈球中，因此也被看做是主角。

还有，在游戏中是反派的火箭队因为戏份突出，多过于除小智外的其他主角，也被视为主角。

宝可梦 THE ORIGIN是以《紅／綠》为原型创作的，但是主角会说话且发言较多，可以看出主角的性格。

宝可梦世代也出现了各代游戏中的一些男性主角，但基本上都没有给出任何正脸镜头，也没有任何台词，整个剧情也是从第三人的视角观察历代游戏的事件。

寶可夢特別篇中的主角，都是以游戏中的主角和一些可以更名的劲敌的形象为原型设计的，每个人各对应一款游戏版本（不包括重制作品），名字一般与对应的游戏版本名相同或相近。其中只有小黄，对应《皮卡丘》的女主角，是原创角色。另外在《綠寶石》中，满充应该是作为第三人登场的（在游戏中作为劲敌之一，漫画中起初图鉴也在他手上），但是漫画绿宝石篇中，主角是原創角色米拉特（一說是參考对战开拓区中的徒弟为原型创作的）。

小蓝最早的形象是出自杉森建绘制的一张宣传画上使用杰尼龟的女性训练家，但是这个女性角色并未在游戏中登场过，只在相关的宣传册中出现。直到《火紅／葉綠》发售之后，女性角色叶子成为了小蓝的新形象蓝本。

在游戏中，克丽丝和琴音被一些同好認為是两个不同角色，但是在特别篇漫画中，则是让克麗絲塔兒换上了琴音的衣服。

《寶可夢》系列衍生作品的主角，一般也是以游戏中的主角为原型的角色。不可思议迷宫系列衍生作品的主角是宝可梦。动画衍生作品的主角则是基于动画中的小智一行人设计的。