统计一行中字符串字符的个数的三种方法:利用excel,利用perl(length函数,tr//),利用vim。统计引物中引物的碱基数目必用

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统计一行中字符串字符的个数的三种方法:利用excel,利用perl(length函数,tr//),利用vim。统计引物中引物的碱基数目必用

2024-07-10 09:43| 来源: 网络整理| 查看: 265

大家在设计引物以后,假如说设计了100个,公司的订单要求提供每一个引物的碱基个数!我们怎么快速的把这100个引物中每个引物中碱基的个数统计出来呢?

方法一:Excel中提供了很好的函数,来帮助我们实现这一功能。

这里我们可以从图中看到我们用了一个函数“=LEN(B2)”。这也就是一个求指定单元格中字符的多少的。

方法二:利用perl,统计每一行中字符串的个数。

在这里,我们把引物复制到一个primer.txt的文件。

然后把结果输出到b.txt的文件中。他们都在f:\perl\的文件夹中,程序如下:

open(PRIMER,"f:\\perl\\primer.txt")||die("can not open the file!"); while( ) { #perl默认把读取的信息存储于$_中 #这里是统计本行中ATGC的个数,也就是我们想得到的引物中碱基的个数 $n=($_=~tr/ATGC//); #下面是存储得到的内容输入到b.txt文件 open (COUNT,">>f:\\perl\\b.txt")||die("can not open the file!"); print COUNT "$n\n"; close (COUNT); }

然后把b.txt文件打开,看到我们想要的结果:

得到的结果和第一种方法是一样的。

这里我们也可以利用perl中的length函数来获取长度。

方法三:在这里我用的文本编辑器是vim,我们可以观察一下,其实vim本身就知道每一行字符有多少个字符,你把光标放到最后一个字符。就可以得到这一行的字符数。

如下图所示:

但是如何可以将其导出?我先想想,然后再更新吧!谁知道的,也给我提个醒。



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