Western blot条带结果分析整理 |
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Western Blot条带结果分析 目录 1 未检测到任何结果 2 高背景 3 出现异常的多个条带 4 条带中出现圆圈 5 条带中出现浅色 6 出现黑点和黑斑 7 条带拖尾 8 出现重影 9 出现非均一性背景 10 某个条带变形 11 条带哑铃型 12 最边缘的条带弯曲 13 蛋白质分子量过高或过低 14 在主条带下方出现条带 15 条带“╰╯”笑脸状（U 形状） 16 条带“╭╮”哭脸状 17 溴酚蓝（前沿染料）拖尾 18 条带出现纵向纹理 19 溴酚蓝占据的范围很粗 20 分离胶中条带无法分离 21 边缘效应 22 脏……全屏条带 23 脏……区域性黑屏 未检测到任何结果出现原因： 加错了抗体，如一抗加的是小鼠抗人，二抗加的是山羊抗兔。 提取的总蛋白中压根没有目的蛋白，如用改变离子强度的方式提取膜蛋白（所以做Input很重要啊）。当然，梦想总是要有的，说不定你也可以在五车酵母上清中提到Cyt c；转移时间过短。 转移电场过弱；转移缓冲液未优化。 凝胶选择不恰当。 转膜时膜放反了（真是个小机灵鬼）。 蛋白上样量太少（小小的细微条带）。 一抗浓度过低（小小的细微条带）。 ECL发光液失效（小小的细微条带）。 无结果1 无结果2 无结果3解决方案： 如果使用湿转法，则需增加转移时间。 增加转移电压或电流。 在转移缓冲液中加入0.01~0.05%的SDS。 将转移缓冲液中的甲醇浓度减少至5%或更少。 使用更低百分比的丙烯酰胺凝胶。 检查上样的量、抗体和反光液的量（小小的细微条带）其他原因及解决办法： 转移时间过长→减少转印时间。 转移电场过强→降低转印电压或电流。 转移缓冲液未优化→组装“三明治”之前，在转印缓冲液中平衡凝胶20分钟以降低凝胶中SDS浓度，从而避免小分子量蛋白的过度转移。将转印缓冲液中的甲醇浓度增加至40%提高其极性有助于从蛋白质中移除残留SDS。 凝胶选择不恰当→使用更高百分比的丙烯酰胺凝胶当目标蛋白分子量小于10KD时使用Tris/tricine 凝胶。 使用0.2μm的印迹膜解决小蛋白转印过度的情况。 小蛋白会穿过大孔径的印迹膜→使用0.2 μm的印迹膜检测小蛋白转印过度情况抗体问题：低活性或低浓度，低亲和力的一抗，错配的一抗和二抗结合比率提高。 抗体浓度： 抗体可能已经丧失活性；进行斑点杂交以确定其活性和最佳浓度。 测试不同一抗和/或一抗/二抗组合。 同时使用阳性对照和阴性对照。 抗原提呈不足增加凝胶中每个样品的总蛋白上样量。 检查样品的完整性;确保蛋白未降解。 抗原被封闭缓冲液封闭尝试不同的封闭液（比如，在检测磷蛋白时避免使用牛奶）。 优化封闭液浓度→建议使用浓度为3~5%的牛血清白蛋白或脱脂奶粉 化学发光底物性能不佳→增加底物孵育时间。 准备少量工作液以确定底物是否已经丧失活性。暗室内，在底物工作液中加入少量HPR偶联物则应该会出现蓝光。如果没有的话，必定是底物或HRP偶联物已丧失活性。 确保底物试剂盒中的两个瓶子之间没有发生交叉污染。两种试剂之间如果发生交叉污染，则会引起试剂活性下降。 叠氮化物是HRP的抑制剂，所以不要在二抗缓冲液中使用叠氮化物。 印迹膜抗体剥离和再杂交优化抗体剥离条件。 仅在必要时进行再杂交检测。 避免对同一印迹膜进行多次重复再杂交。 蛋白质未转移→优化目标蛋白转移效率。 高背景目的条带单一清晰，但其他地方弥漫着连续性的单一背景。是WB最常见的问题之一，注意操作规范，不偷工减料，洗膜按照规定来5min×5次或者10min×3次，不要改成5min×3次，或者10min×2次。 出现原因： 为封闭不完善（脱脂牛奶多加点）。 一抗浓度过高导致出现了非特异性结合。 洗膜的时间及次数不足导致未洗脱游离抗体。 出现异常的多个条带 多条带1 多条带2出现原因： 可能是一抗与杂蛋白出现了非特异性结合。 抗体浓度过高。 非特异位点封闭不足。 向封闭缓冲溶液中加入0.05%的Tween®20。 SDS使抗体和固定的蛋白条带发生非特异性结合。解决方案： 可尝试更换一抗（你的一抗实在是太屎了花点钱重买一个吧）。 降低抗体浓度。 提高封闭剂浓度，如从5%提高到7%。 增加封闭时间和/或提高温度。 抗体稀释液采用相同的封闭缓冲液(加入0.05%的 Tween®20)。 转移后洗涤印迹膜。 在免疫检测过程中不要使用SDS。 抗体质量尝试使用不同抗体。 条带中出现圆圈出现的原因是电转时PAGE胶与尼龙膜之间存在气泡。 出现气泡的原因基本上是在转膜过程中转移“三明治”组装不恰当。 半干法 湿法解决方法： 在组装转移“三明治”的时候使用更多的转印缓冲液。 确保在组装“三明治”的时候移除凝胶和印迹膜之间所有的气泡。 在抗体孵育前用丽春红S为印迹膜染色，以检查转移质量。 尽量不要使用半干法（使用湿法转膜，即泡在整个的转移buffer溶液中）。 将“三明治”压压紧。操作注意： 我们常常将电转液倒入一个盘子里，倒入的液体不能太多也不能太少，最好的高度是与放上第一层滤纸齐平，然后往滤纸上浇点转膜液，把电泳胶用清水清洗下，将电泳胶平铺到滤纸上，仔细检查滤纸与胶之间是否有气泡，可以左右前后观察，不同方向观察之后确认无气泡，然后再往胶上面浇点电转液，用两只手的拇指和食指轻轻夹住PVDF膜的两侧中间，使膜成U型，然后将U型的底部接触胶的中间，慢慢往两边放下膜，这样一般气泡很少。然后上层滤纸同样用U型的放置方法，用玻璃棒稍微贴实下，然后盖上海绵。注意不要来回赶气泡，这样反而会带入气泡。 条带中出现浅色中心部位高浓度的辣根过氧化物酶（HRP）等消耗底物过快，使得胶片曝光时底物已消耗殆尽。解决方法是降低蛋白量，降低一抗和二抗浓度，加快X光片定影。 出现黑点和黑斑出现原因： 凝胶碎片粘附于印迹膜之上；成块的封闭剂粘附于印迹膜之上。 抗体聚合。 缓冲液污染。 一抗与膜某些地方非特异性结合。 黑点和黑斑解决方案： 将印迹膜表面残留的丙烯酰胺凝胶碎片移除。 确保封闭剂在使用前完全溶解。 向封闭缓冲溶液中加入0.1%的Tween-20®。 使用0.2μm的过滤器过滤抗体缓冲液。 使用新鲜抗体、向抗体缓冲溶液中加入0.1%的 Tween-20®。 使用新的缓冲液或使用0.2μm的过滤器过滤缓冲液。 封闭牛奶一定要纯，封闭结束之后要洗，如果没有完全溶解的情况下加牛奶倒膜上，会导致很多不溶性颗粒附着在膜上，这就会导致发光时候膜上的黑点。 条带拖尾蛋白量过大，一抗的浓度过大，加入的时间过长，洗一抗和洗二抗不要凑活，一定要5min×5次。样品溶解度不佳。 出现重影荧光强度较高，压片曝光时，胶片放好后又移动了一段距离。不要瞎动，放歪了也不要调整。（有的时候出现重新刚好在上下位置，并且重影会相对弱一些，不要误以为抗体识别了该蛋白的另外一种异构形式。） 出现非均一性背景可能的原因是膜干了失水皱缩，所以多加点水。 某个条带变形PAGE胶中可能存在气泡或不溶性颗粒，故配胶时要小心，使用无杂质液体。制作“三明治”时也要压紧。更换陈年老用的海绵垫。 条带哑铃型更换更高品质的PAGE胶。 最边缘的条带弯曲电泳电流不均一，可换用新的电泳槽，不使用两边的泳道。 蛋白质分子量过高或过低出现原因： 胶配置的浓度与蛋白质分子浓度不符。 当然也有可能是蛋白质中碱性氨基酸过多导致SDS无法屏蔽这些正电荷，或者蛋白质中脯氨酸含量过高。 抗体用错了，变性不彻底出现二聚体或者多聚体； 蛋白修饰，蛋白剪切； 非特异性的蛋白强于待检测的样品。解决方案：用特异性高的抗体检测，变性彻底。 在主条带下方出现条带蛋白质降解，下方产生的模糊不清的小条带是其碎片。提取蛋白的时候PMSF（苯甲基磺酰氟，蛋白酶抑制剂）多加点。 条带“╰╯”笑脸状（U 形状）凝胶冷却不均一，电泳槽老化，在上样的时候没有吹打干净、跑胶电压过大造成拖尾。 笑脸 条带“╭╮”哭脸状凝胶的左右两头没有固定好。 溴酚蓝（前沿染料）拖尾样品溶解度不好。 条带出现纵向纹理上样样品中存在不溶性颗粒。 溴酚蓝占据的范围很粗浓缩胶效果不好。 分离胶中条带无法分离缓冲液pH不正确，或者SDS加的太少。 边缘效应出现于胶图的两端最靠边的条带，会发现跑出来的带不是水平直线。 边缘效应解决方案：宁可将Loading buffer加到两边也不要将样品加到两边。 脏……全屏条带出现原因： 一抗和/或二抗浓度过高。 非特异位点封闭不足。 使用了错误的封闭缓冲溶液。 洗涤不足增加洗涤次数和缓冲液用量（最少5×5分钟）。 曝光时间过长。 印迹过程中印迹膜变干。 缓冲液重复利用导致污染。解决方案： 全屏黑 稀释一抗和/或二抗浓度。 提高封闭剂浓度，如3~5% 的牛血清蛋白、酪蛋白、脱脂牛奶. 降低封闭时间和/或温度。 向封闭缓冲溶液中加入0.05%的Tween®-20。 一抗和/或二抗与 封闭缓冲液中的蛋白相结合或者尝试其他封闭剂（白蛋白、酪蛋白、脱脂牛奶等）。 在使用亲和素-生物素系统时不要使用牛奶来封闭印迹膜，因为牛奶含有生物素。 增加洗涤次数和缓冲液用量(最少5×5分钟)。 如果洗涤液中未含有0.1%的Tween®-20，请添加。 减少成像曝光时间。 确保印迹膜保持湿润，覆盖有足够液体以防止其变干。 使用新制缓冲液。 脏……区域性黑屏出现原因： 部分印迹膜变干。 洗涤缓冲液与某些印迹区域接触不足。 洗涤缓冲液与某些印迹区域接触不足。 印迹膜污染。解决方案： 局域黑 确保印迹膜保持湿润，一直覆盖有足够液体以防止其变干。 增加洗涤缓冲液用量。 避免过多印迹堆叠在一个孵育容器内。 使用干净的或新的转移三明治；请勿用手直接接触印迹膜，一直配戴清洁手套或使用医用镊子。 确保电泳设备、转移设备和孵育盘清洁，远离外部污染源。[1] [2] ↑ 本文档由拟态章鱼编写，由恺凌、Eric校对审核。 ↑ [1]Western Blot 原理、protocol--及条带常见问题分析.与你畅游世界 |
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