1、什么情况下用RNAseq RNAseq是一种高通量测序技术。它可以帮助我们理解在各种比较条件下，所有基因的表达情况的差异。简单的理解，就是RNAseq可以得到同种不同类型的两类细胞间的基因表达差异。 以正常的神经细胞和发生突变的神经细胞为例。这两种细胞的行为表现不同，我...

关于RNAseq Nature重磅综述 |关于RNA-seq，你想知道的都在这[https://app.yinxiang.com/fx/f8c7f63c-a05e-4ebf-bd10-3f0dae3ae315] 准备工作 先在服务器安装conda。安装好通过conda进一步...

STAR+RSEM+Deseq2视频课程链接已经公开, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=8[https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=8] B站上有大量生信干货, ...

参考这些主要根据这篇操作！！！[https://www.jianshu.com/p/970012d1b051/]💥💥💥我觉得学RNA-seq必看的文献！！💥💥💥[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=22...

参考：https://github.com/shenmengyuan/RNA_seq_Biotrainee 基础知识部分 Fastqc 碱基质量分布图 横坐标代表每个每个碱基的位置，反映了读长信息，比如测序的读长为150bp,横坐标就是1到150； 纵坐标代表碱基质量值， ...

B站：RNA-seq转录组数据分析入门实战 1 linux常用命令 .bashrc中可以添加一些常用快捷方式，也可以将软件添加到环境变量如何用vi编辑和保存文件[https://zhidao.baidu.com/question/505053915.html] 2 cond...

前言 接下来我们要介绍的是 RNA-seq 数据的处理分析流程，根据 RNA-seq 测序技术的不同，可以分为三种： short-read long-read direct RNA-seq 而我们一般的 RNA-seq 测序数据分析流程算法，基本上都是基于 short-re...

superqun原创 一、流程概括 RNA-seq的原始数据（raw data）的质量评估 linux环境和R语言环境 raw data的过滤和清除不可信数据（clean reads） reads回帖基因组和转录组（alignment） 计数（count ） 基因差异分析（...

一、安装软件 1、HISAT2 将reads比对到基因组上 2、StringTie 将比对好的reads进行拼装并预计表达水平 3、SAM tools 课上已经用sudo apt install samtools 安装 4、gffcompare 将基因和转录本与注释进行比较...

以上两张图是fastqc的结果，都表明样本序列中是含有接头序列的，adapter content的结果为fail。必须去接头才能进行下一部的序列比对、表达定量等等。Trimmomatic是一个可以用来处理Illumina公司raw reads，去掉接头adapters的软件...

本次实战我采用的是B站某教程上的拟南芥数据，教程链接：https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=1 构建项目目录，并导入文件 00ref中的gtf注释文件信息和fasta参考基因文件，可以用wget命令在数据库中下载 拟...

知识的学习没有一蹴而就，没有捷近，扎实的学习是唯一的捷近。 一篇RNA-seq分析流程的综述，全面而详细！深度好文，可用来反复阅读。初学者用于把握RNA-seq真个流程及各个流程选择上的差异。已经开始学习者可用来查缺补漏和发现新的分析角度。 A survey of best...

一篇RNA-seq分析流程的综述，全面而详细！深度好文，可用来反复阅读。初学者用于把握RNA-seq真个流程及各个流程选择上的差异。已经开始学习者可用来查缺补漏和发现新的分析角度。 A survey of best practices for RNA-seq data an...

原文来源：Conesa A, Madrigal P, Tarazona S, et al. A survey of best practices for RNA-seq data analysis[J]. Genome biology, 2016, 17(1): 13. 1...

这是目前为止我看到过的关于ATAC-seq的最新综述，感兴趣的话值得一读。2020.4.22更新：我看到一个公众号也翻译了这篇文章，而且正好跟我这篇翻译是在同一天发表https://mp.weixin.qq.com/s/7JAEPDuEEsmRxXI3UZDZHQ。他的文字...

Substrate的transaction-payment模块分析 transaction-payment模块提供了转账包括的最小数量的手续费收取逻辑。 weight fee:根据一个交易所消耗重量成比例的手续费。 length fee:根据一个交易编码后长度成比例的手续费...

16宿命：用概率思维提高你的胜算 以前的我是风险厌恶者，不喜欢去冒险，但是人生放弃了冒险，也就放弃了无数的可能。 这个冒险是主观的，我们是否可以把冒险来量化，用数字来计算概率。 宿命：用概率思维来提高胜算，也许只是偷看天书的一页，有了这个概率我们总是能寻找到什么是对的什么是...

公元：2019年11月28日19时42分农历：二零一九年 十一月 初三日 戌时干支：己亥乙亥己巳甲戌当月节气：立冬:2019年11月08日02:42中气：小雪:2019年11月22日00:06当前旬空：戌亥(日空) 申酉(时空)小雪中元：阴遁八局起局：拆补法值符天柱落七宫 ...

年纪越大，人的反应就越迟钝，脑子就越不好使，计划稍有变化，就容易手忙脚乱，乱了方寸。 “玩坏了”也是如此，不但会乱，而且很容易犯错。其实犯错也不怕，可怕的是同样的错误会一犯再犯，比如说忘记打卡。 现在手机打卡软件很多，健身的、读书的、早起的，都是为了使大家能够形成良好的习惯...

感动 我在你的眼里的样子，就是你的样子。 相互内化 没有绝对的善恶 有因必有果 当你以自己的价值观幸福感去要求其他人的话，便是罪恶交织的开端了 人果然都是混沌的。 安好

想要快速入门CAD，对于零基础的新手来说的确有一定的困难。不过只要你掌握了以下这些CAD快速入门技巧，你就跨进了CAD的门了。 一、知道什么是CAD，主要用来干什么 CAD，也叫计算机辅助设计，CAD主要包括交互技术、图形变换技术等。我们日常生活中所说的CAD是指一种专业的...

昨天考过了阿里规范，心里舒坦了好多，敲代码也犹如神助。早早完成工作回家喽

三军可夺气，将军可夺心。是故朝气锐，昼气惰，暮气归。善用兵者，避其锐气，击其惰归，此治气者也。以治待乱，以静待哗，此治心者也。以近待远，以佚待劳，以饱待饥，此治力者也。无邀正正之旗，无击堂堂之陈，此治变者也。 对于敌方三军，可以挫伤其锐气，可使丧失其士气，对于敌方的将帅，可...

追星逐渐从心理上的偏好转向致力于打榜花钱的形式主义，明星信息的公开化与非法售卖也导致私生饭等盲目甚至变性的行为屡见不鲜，毫无保留的释放内心情感往往适得其反，追星应更加注重行为情绪上的有序性及合理性，而不在成本的无限制累加。 形式化的花费真的能获得内心的满足感吗？粉...