ImageJ自动批量多通道图片无损分离为单色荧光图 |
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ImageJ自动批量多通道图片无损分离为单色荧光图
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一共只需4步，ImageJ就可以将多通道的TIF图片中红绿蓝三色分开，并形成三张无损纯色荧光tif图片。 准备： 在桌面上（必须是桌面）创建2个文件夹，分别为文件夹1和文件夹2。 将需要拆分的多通道图片放入文件夹1中。可以放多张。 将文件夹2重命名为1CHANNEL。 （如果重命名为其他，则相应的需要将下面代码中所有的“1CHANNEL"改为为对应的名称。） 开始：打开ImageJ Process → Batch → MacroInput选择文件夹1Output空着。将以下代码复制粘贴到代码框，按process即可。 ID=getTitle(); run("Duplicate...", " ");//复制一张图片 ID1=getTitle(); ID2=ID+"2.tif"; selectWindow(ID1);//选择刚刚复制的图片，并拆出2张黑色图片用于合成 run("Select All"); run("Cut"); run("RGB Stack"); run("Stack to Images"); selectWindow("Red"); close(); selectWindow("Green"); rename("Black1"); selectWindow("Blue"); rename("Black2"); selectWindow(ID);//选择原始图片，拆分通道。 run("RGB Stack"); run("Stack to Images"); path=getDirectory("home")+"Desktop"+File.separator+"1CHANNEL"+File.separator+ID; run("Merge Channels...", "c1=Red c2=Black2 c3=Black1 keep"); selectWindow("RGB"); rename(ID); saveAs("tiff", path); path1=getDirectory("home")+"Desktop"+File.separator+"1CHANNEL"+File.separator+ID1; run("Merge Channels...", "c1=Black1 c2=Black2 c3=Blue keep"); selectWindow("RGB"); rename(ID1); saveAs("tiff", path1); path2=getDirectory("home")+"Desktop"+File.separator+"1CHANNEL"+File.separator+ID2; run("Merge Channels...", "c1=Black1 c2=Green c3=Black2"); selectWindow("RGB"); rename(ID2); saveAs("tiff",path2); selectWindow(ID);详细步骤如下：(括号内为快捷键) 打开多通道TIF图片Image → Duplicate (shift+D)Edit → Selection → Select All (A)Edit → Cut （X）Image → Type → RGB stackImage → Stacks → Stacks to Images，生成三张纯黑的图Image → Rename，将刚刚生成的三张图更名为“Black1”，“Black2”，剩下的一张关掉选中最开始的原图Image → Type → RGB stackImage → Stacks → Stacks to ImagesImage → Color → Merge Channels重复三次11步，如下三幅图进行设置，即可获取三张纯色无损荧光图片。
获得红色无损荧光图 获得绿色无损荧光图 获得蓝色无损荧光图 正文已结束！如有疑问欢迎加博主微信w2689115745交流 |
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