记录贴:医学生从0开始R语言实战用survminer包画漂亮的生存曲线图 |
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《临床回顾性研究实用指南》王擎主编:P197:SPSS软件自动输出的K-M曲线并不美观,不能满足高水平文章的发表要求。建议读者调用R包“survminer”中的ggsurvplot()的函数绘制K-M曲线,通过自定义函数的参数进行相应的统计图形设置。 1.R软件的下载与安装 (1条消息) Day01零基础自学R语言(最详细教程)——R软件安装_源代码•宸的博客-CSDN博客_r语言 2.RStudio是R的集成开发环境(IDE),下载安装 RStudio的安装_QT-Smile的博客-CSDN博客_rstudio安装教程 3.survminer包及读取Excel包的安装(非常重要!尤其时第一次开始做或者好久不做了,R和RStudio更新后,很多包需要重新安装和加载) install.packages("survminer") install.packages("readxl")(3条消息) R语言:利用survminer包实现生存分析及可视化_Geek小海绵的博客-CSDN博客_survminer 4.准备好自己要分析处理的数据 Excel整理好想要纳入R中分析处理的数据,保存为csv格式。 或者通过“File”菜单 中"Import Dataset" 下拉菜单来导入。参考以下链接: 用RStudio导入数据 - 知乎 此处原文件内切记做好数据序号id的标注,否则会出现一些奇怪报错。 5.仿照以下代码,绘制OS图线: #清理运行环境 rm(list=ls()) #加载R包 library(survival) library(survminer) library(ISwR) library("survminer") require("survival") #导入数据 library(readxl) 此处是data缩写 因人而异 实操需替换 |
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