去芜存菁,定量未来

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去芜存菁,定量未来

2023-10-21 22:34| 来源: 网络整理| 查看: 265

代谢物作为在分子水平上对表型进行动态和敏感的测量手段已被广泛接受,使代谢组学成为与病理生理过程相关生物标志物和机制探索研究的前沿,并逐渐在多个领域得到广泛的应用。如疾病研究、食品营养、环境毒理、植物等与人类健康护理密切相关的领域。

传统靶标代谢组学针对已知的少数代谢物进行检测,需要具有一定的研究基础,针对目标代谢物建立合适的方法;而高分辨质谱无需预先知道样本中含有哪些代谢物,只需将样本按照通用的流程进行前处理,利用质谱高分辨质谱的全扫描模式对待测样本进行分析,尽可能多的得到代谢物的信息。如果有一种方法,能将高分辨质谱获得的数据导入三重四极杆方法中,则可以同时获得靶标和非靶标代谢组学研究的优势。这种研究方法称为“拟靶标”代谢组学,是近几年发展的一项新型研究方法,逐渐得到研究者的青睐。

图:拟靶标代谢组学整体解决方案流程图

本文结合Orbitrap ID-X 三合一超高分辨质谱 和 TSQ Quantis三重四极杆质谱的优势,配合智能的Compound Discoverer数据分析,开发了完整的拟靶标代谢组学流程。

将靶标和非靶标代谢组学的优势相结合,具备非靶向代谢组学无偏向性分析的优势,同时可针对高、低丰度代谢物进行优化,从而获得更好的灵敏度、重现性;在植物和生物样本中分别作了验证,采用此方法与非靶标代谢组学的方法相比,结果发现,两种方法在色谱保留行为,多维统计分析结果均保持一致,表明所建立的拟靶标代谢组学具有非常好的可行性。


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