保姆级NHANES数据库使用教程 |
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该数据库所涉及的参与者的死亡状况存在另一个数据库:NDI数据库。网址为https://www.cdc.gov/nchs/ndi/index.htm,如下图: 那,如何从NHANES数据库下载研究所需要的数据呢? Step 1. 点击1处或2处直接进入数据下载页面(如下图) Step 2. 可以从下图中的1、2、3处下载数据。 从1或3处可以按年份下载,每个年份包含Demographics Data”(人口数据)、“Dietary Data”(饮食数据)、“Examination Data”(检查数据)、“Laboratory Data”(化验数据)、“Questionnaire Data”(问卷数据)、“Limited Access Data”(限制访问数据)。 点击相应的图标即可进入下载页面,本文以下载2009-2010年份的人口数据为例。注意2020-2022年的数据目前还不能下载。 Step 3. 点击数据文件即可下载数据XPT文件,该格式数据可以用SPSS软件打开,也可以用R软件打开。 点击变量注解,进入变量解释页面,主要关注右边的codebook栏,是对变量的具体解释,非常重要(尤其是在调查问卷文件中)。 左边栏的codebook和Frequencies 中是对字段值的解释,比如:gender中的1 代表male,2 代表female,点代表缺失。 Step 4. 数据处理,可采用SPSSR软件、R软件或Excel 处理。 数据处理方法(1):SPSS数据导入及处理。 a. 格式转换XPT文件格式转化为另存为sav文件或者xlsx文件,以方便处理。 b. 数据合并。 打开先要合并的数据,选中需添加的表格,这里以在数据集1上添加数据集2中的变量,并剔除不需要的变量为例,操作演示如下图的五个步骤,注意的是两个数据集的相同变量为键变量,即患者序列号(SEQN)。 数据处理方法(2): 用R-Studio软件导入及初步处理数据 a. 在R-Studio 安装"foreign"包。 采用镜像安装比较快(这里采用的是阿里镜像) 具体代码如下: options(repos=structure(c(CRAN="http://mirrors.aliyun.com/CRAN/"))) install. packages("foreign") b. 把XPT文件放入R软件下的文件夹 备注:如果不清楚该文件路径,可以运行getwd() 语句获取相应的文件路径 c. 导入XPT文件(如下例子读取了四个XPT文件) library(“foreign”) mydata1 |
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