日期：2021.10.10

整理&排版： @青衫微薄儒少年

内容：

比叶面积（specific leaf area，SLA） 即叶片的单面面积与其干重的比值。比叶面积直接受叶片的厚度、形状和重量等的影响，在一定程度上反应了叶片截获光的能力和在强光下的自我保护能力，其往往与植物的生长和生存对策有紧密的联系，能够反映植物在不同生境下的资源获取能力和对不同生境的适应特征。同时，比叶面积也是评价群落生存力水平及其结构是否合理的指针之一。此外，比叶面积也常被认为是研究特定环境下植物生理生态学策略的首选指标。

拓展一下：

（1）叶片性状是植物适应环境所体现出的叶片水平上的特征参数，对于环境的变化具有重要的指示意义。比叶面积是植物的一个关键叶片性状，对植被的更新、群落以及生态系统演替具有重要的指示意义。

（2）不同树种的比叶面积存在明显的差异，指示不同功能树种存在的生存策略；有研究表明：随着光照强度的降低，所有树种比叶面积呈现增加的趋势，尤其是弱光和低光照相对全光和中光照差异显著。

（3）不同树种比叶面积随光照强度的变化幅度明显不同，且变化最显著的光照区域也有所不同。所有树种均能够通过改变叶片心态来适应光照条件的变化，如：在低光照条件下，植物通过增加单位质量叶面积，提高叶片的光捕获能力。但各树种对光照强度变化的不同响应则间接表明树种之间的光适应机制，这对森林生态系统内部树种的共存（生）具有重要意义。

日期：2021.10.11

内容：

嵌套分组（系统分组）设计是指一个因子（A）的某一水平与另一因子（B）的某几个水平发生组合，A因子的另一水平与B因子的另几个水平发生组合，或者说B因子的不同水平是嵌套在A因子的不同水平内的，因而，称A因子为一级因子，B因子为二级因子。（ps：这种嵌套还可以延续，如果还有第3个因子C，C因子的不同水平又可以嵌套在B因子的不同水平内，称C为三级因子。）

数据形式：

那么，我们如何在SPSS中实现嵌套分析？

实例1：

在三个不同地区，每区随机抽查了四个样群，每群5株野玫瑰的单株结实数如下表，试就这些资料分析野玫瑰结实数在地区间或样群间有无显著差异？

将上述数据整理至Excel，进而输入到SPSS中，之后按照步骤进行分析即可✌

（ps：详细实现过程请移步gzh：CHUKEH的木屋，回复：嵌套分析 即可获得实现详解PPT）。

日期：2021.11.04

Linear Mixed Model（LMM），是即包括固定因子，又包括随机因子的模型。该模型被广泛应用于物理、生物和社会科学等研究领域当中。混合效应模型体现因变量和一些协变量之间的关系。模型中至少有一个协变量是类别协变量（例如，个体）。

日期：2021.11.06

Ⅰ 萌发率：GR(%) = (n/N)×100%

注：n为最终达到正常发芽粒数，N为供试种子数。

Ⅱ 发芽势：GE(%) = (n/N)×100%

注：n为4d内正常发芽粒数，N为供试种子数。

Ⅲ 发芽指数：

注：Gt 为处理后t日的发芽书；Dt为相应的发芽日数

一般以7d计，eg: 。

日期：2021.11.07

Ⅰ R语言

相比较于其他常用的软件，R的优势主要在于：是专为数据分析而量身打造的一款开源软件，并且主要用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、开源的软件。它是一个用于统计计算和统计绘图的优秀工具。此外，R语言还具有一系列的数据可视化包，包括ggplot2计ggplot2拓展包、lattice、leaflet、playwith、ggvis、ggmaps等。R还提供了部分地图绘制功能，地区数据分析提供了有关地区分析的综合性R工具列表。另外，用户可以下载《地理统计制图使用指南》——这是一本关于如何使用R及其他工具分析空间数据的相关知识的电子书，免费下载。

Ⅱ Origin

Origin 是OriginLab公司出品的较流行的专业函数绘图软件，是公认的简单易学、操作灵活、功能强大的软件。它的特定在于：不仅可以满足一般用户的制图需要，也可以满足高级用户对数据分析、函数拟合等需求。Origin自1991年问世以来，由于其操作简要、功能开放，很快就成为国际流行的分析软件之一，是公认的快速、易学、灵活的一款绘图软件。自Origin2017版起，绘制的图表美观性大大提高。{可以戳下方的视频进行简要了解，(●'◡'●)}

Ⅲ GraphPad Prism

GraphPad Prism 是一款集数据分析和作图为一体的数据处理软件，尤其适合生物医学类，可以直接输入原始数据获得高质量的学术图表。它在统计上劣于SPSS等统计软件，但是无需输入程序语言（代码），只需要原始数据，其操作容易、绘图美观，输出分辨率较高；其次，绘图完成后与PPT、Word联动性良好。

——摘自《R语言数据可视化之美：专业图标=表绘制指南》（增强版）

日期：2022.3.12

不同的种子，破休眠的方法也有很大的差别，虽初始时，尚能够记忆一部分，但随着时间的推移他们将被分解成碎片...遂记录。

禾本科种子：破休眠时常用温水（40℃）浸泡 8h - 24h 后吸干水分，置于苗床上育苗（或播种于目标土壤）。

硬实类种子：常需要用一些物理或化学的方法将种壳（或防水膜，常覆于种子表层）破开（处理），之后再使用温水（根据不同种子使用不同的始温，常50-85℃）浸泡，最后置于苗床上进行育苗处理。

多年生草本：以PA（Phytolacca americana L.）为例，这个植物的育苗方法，前后换过几次配方，最后终于育苗成功，哈哈哈。

日期：2022.3.21

磷脂脂肪酸 (Phospholipid fatty acids, PLFA) 是活体生物细胞膜磷脂的重要成分，由于不同类群微生物能通过相应生化途径形成特定的 PLFA ，使部分 PLFA 总是出现在同一类群的微生物中。因此 PLFA 具有较高的结构多样性和生物学特异性，可作为区分活体微生物群落生物标记的基础，也成为微生物分类的主要依据。

中性脂肪酸 (Neutral lipid fatty acid, NLFA)

日期：2022.3.22

菌根（Mycorrhizas）是普遍存在于植物根系和土壤真菌之间的互惠共生体。通过这两个共生伙伴之间亲密的细胞接触，菌根真菌从进行光合作用的寄主那里获得固定的碳，以交换磷和氮等矿物质营养，这对植物生长有积极影响。共生对寄主植物的有益影响还包括提高了其对生物和非生物胁迫的耐受性。此外，菌根在自然和农业环境中提供多种生态系统服务。菌根真菌是土壤中碳封存和颗粒聚集的已知驱动者，对微生物和植物群落的组成有重大影响。基于这些原因，菌根被认为塑造了自植物陆地化以来的生物圈进化，并且在当前日益增长的环境关注的背景下，它们是生态系统功能的重要角色。

图1.主要的菌根类型。a、外生菌根（ectomyrhizas， ECM）主要涉及树木和灌木，内生菌根（endomycoras，包括杜鹃花类菌根（局限于杜鹃花科），兰花菌根（ORM；局限于兰科）和更广泛的丛枝菌根（AM）。b、显示了互惠共生菌根中营养物质的相互交换。在AM中，植物通过光合作用固定的有机碳被转移到真菌体内，并从中交换土壤中的水分及其它含磷、氮、硫和其它必需营养素的无机化合物。c、一些真菌种类，如红菇科，发展了不同类型的菌根相互作用：ECM与树种，ORM与兰花。d、相反的情况是，一个单一的寄主（如杨树）可以同时发展AM和ECM。e、图中显示了植物群落中共同菌根网络的形成，真菌菌丝在这里定植并连接不同植物的根，从而实现了营养和信号的交换。

虽然大多数植物能够形成菌根，但菌根分布不均匀， AM是主要类型（72%），其次为ORM（10%）、ECM（2%）和ERM（1.4%）。多种菌根类型在许多生态系统中共存，植物和真菌物种在某些情况下建立了一种以上的菌根（图1）。

日期：2022.4.07

⭐将引言作为一篇完整的议论文进行写作，主要论点就是本篇论文研究目标的合理性。将引言与研究目标作为一个整体来进行考虑。

写作要点：

（1）第一段：确立研究机会。

第一步，描述一个较为普遍的大问题、读者比较关切的问题。第二步，确立一个研究空白，也就是具体的研究问题。

（2）第二段：提出解决方案，占领该研究机会。

清晰地描述研究目标，填补第一段中确立的研究空白。不仅描述本篇论文的目标，而且包括作者的长期目标。长期目标要和普遍的大问题相呼应，本篇论文的目标要和具体的研究问题相呼应。

即，第一段：为了解决某个普遍的大问题，我们需要解决某个具体的研究问题；第二段：为了实现长期目标，首先要实现本篇论文的目标。

⭐引言的作用：

引言就好比我们在读者与我们所做的研究之间搭一座桥，我们要做的就是引导读者走过桥来，通过描述读者已知的问题，与读者现有的知识框架建立某种联系，在引言的开头提出读者比较关切的问题，并且从读者已经接受或认同的观念入手，然后逐渐加入读者未知的文献资料，并且以这些文献资料作为理由，说服读者有一个具体的研究问题值得研究，我们包括读者应该知道它的答案，而这个具体的研究问题（Question）就对应了我们的具体研究目标（Objective）。