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跟着 Cell 学作图 | 3.箱线图+散点+差异显著性检验
“实践是检验真理的唯一标准。” “复现是学习R语言的最好办法。” 
DOI: 10.1016/j.cell.2020.05.032 这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。今天带大家复现其中的一个Supplemental Figure：带散点的箱线图。 本文代码及示例数据领取：后台回复“20210416” 
2021.4.16_1
比较常用的展示差异的可视化方法。 数据格式
2021.4.16_2
注：以上数据纯属虚构，无实际意义！ 思路箱线图+显著性检验+散点 均值比较的常见方法： 方法R实现函数描述T-testt.test()比较两组(参数检验)Wilcoxon testwilcox.test()比较两组(非参数检验)ANOVAaov()或anova()比较多组(参数检验)Kruskal-Walliskruskal.test()比较多组(非参数检验) 绘制 #------ title: "boxplot" author: "MZBJ" date: "2020/4/16" #----- # 导入所需的包 library(ggplot2) library(ggsignif) library(ggpubr) library(RColorBrewer) setwd("F:/HJH/mzbj/cell") # 导入数据 plot_data |
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