R语言

您所在的位置:网站首页 r语言gam模型筛选变量 R语言

R语言

2023-11-27 16:45| 来源: 网络整理| 查看: 265

本文接 预测模型变量筛选:方法篇

基因表达量高低分组的cox和连续变量cox回归计算的HR值差异太大? | 生信菜鸟团 (bio-info-trainee.com)

常见回归模型评估方法

平均绝对误差,Mean Absolute Error (MAE):预测值与真实值之间平均相差多大;

均方误差,Mean Square Error (MSE):是指参数估计值与参数真值之差平方的期望值。MSE是衡量平均误差的一种较方便的方法,MSE 可以评价数据的变化程度,MSE的值越小,说明预测模型描述数据具有更好的精确度。

R平方值,R-Squared (R²):它是表示回归方程在多大程度上解释了因变量的变化,或者说方程对观测值的拟合程度如何。

其他

  RMSE:均方误差平方根;

  校正R²:对原始R²的改进:

  Cp:马洛斯CP值:

  AIC(赤池信息准则)和BIC (贝叶斯信息准则)

回归与判定标准

逐步回归,模型判定:AIC,值越小模型越优; 

全子集回归,模型判定,调整R²,值越大模型越优,BIC和CP值越小越好;

Lasso回归+交叉验证:模型判定,MSE,具体见下文。

目录

单因素Cox初筛变量

最优子集回归初筛变量

Lasso回归+交叉验证初筛变量

三种方法筛选的变量纳入多因素Cox进行最终筛选

用三种方法最终选出的变量构建模型并进行比较

最佳的模型将用于构建预测模型Nomogram

本文筛选变量和建模思路

1.  三种方法筛选变量;

   1-1. 单因素Cox以P



【本文地址】


今日新闻


推荐新闻


CopyRight 2018-2019 办公设备维修网 版权所有 豫ICP备15022753号-3