R 语言 stats 包中的函数

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R 语言 stats 包中的函数

2023-06-27 15:15| 来源: 网络整理| 查看: 265

我们已经学习了 R 语言的基础知识,包括其语法以及语法所对应的语义,现在准备使用 R 向统计学领域进发。本文是 R 系列的第十一篇文章,我们将学习如何使用 R 语言 stats 包中提供的统计函数。

与此系列之前的文章一样,我们将使用安装在 Parabola GNU/Linux-libre(x86-64)上的 R 4.1.2 版本来运行文中的代码。

$ R --version R version 4.1.2 (2021-11-01) -- "Bird Hippie" Copyright (C) 2021 The R Foundation for Statistical Computing Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. You are welcome to redistribute it under the terms of the GNU General Public License versions 2 or 3. For more information about these matters see https://www.gnu.org/licenses/mean 函数

在 R 中 mean 函数用来计算算术平均值。该函数接受一个 R 对象 x 作为参数,以及一个 trim 选项来在计算均值之前剔除任意比例的数据(LCTT 译注:比如对于一个含有 7 个元素的向量 x,设置 trim 为 0.2 表示分别去掉 x 中最大和最小的前 20% —— 即 1.4 个 —— 的元素,所去掉的元素的个数会向下取整,所以最终会去掉 1 个最大值和 1 个最小值;trim 取值范围为 [0, 0.5],默认为 0)。逻辑参数logical argument(TRUE 或 FALSE)na.rm 可以设置是否忽略空值(NA)。该函数的语法如下:

mean(x, trim = 0, na.rm = FALSE, ...)

该函数支持数值、逻辑值、日期和 时间区间time intervals。下面是使用 mean 函数的一些例子:

> mean(c(1, 2, 3)) 2 > mean(c(1:5, 10, 20)) 6.428571 > mean(c(FALSE, TRUE, FALSE)) 0.3333333 > mean(c(TRUE, TRUE, TRUE)) 1

我们使用 UCI 机器学习库提供的一个采集自葡萄牙银行机构的“银行营销数据集”作为样本数据。该数据可用于公共研究,包含 4 个 csv 文件,我们使用 read.csv() 函数导入其中的 bank.csv 文件。

> bank bank[1:3,] age job marital education default balance housing loan contact day 1 30 unemployed married primary no 1787 no no cellular 19 2 33 services married secondary no 4789 yes yes cellular 11 3 35 management single tertiary no 1350 yes no cellular 16 month duration campaign pdays previous poutcome y 1 oct 79 1 -1 0 unknown no 2 may 220 1 339 4 failure no 3 apr 185 1 330 1 failure no

下面是计算 age 列均值的示例:

> mean(bank$age) 41.1701median 函数

R 语言 stats 包中的 median 函数用来计算样本的中位数。该函数接受一个数值向量 x,以及一个逻辑值 na.rm 用来设置在计算中位数之前是否去除 NA 值。该函数的语法如下:

median(x, na.rm = FALSE, ...)

下面是使用该函数的两个例子:

> median(3:5) 4 > median(c(3:5, 50, 150)) [1] 5

现在我们可以计算银行数据中 age 列的中位数:

> median(bank$age) 39pair 函数

pair 函数用来合并两个向量,接受向量 x 和向量 y 两个参数。x 和 y 的长度必须相等。

Pair(x, y)

该函数返回一个 Pair 类的列数为 2 的矩阵,示例如下:

> Pair(c(1,2,3), c(4,5,6)) x y [1,] 1 4 [2,] 2 5 [3,] 3 6 attr(,"class") [1] "Pair"

该函数常用于像 T 检验和 Wilcox 检验等的 配对检验paired test。

dist 函数

dist 函数用来计算数据矩阵中各行之间的距离矩阵,接受以下参数:

参数

描述

x

数值矩阵

method

距离测量方法

diag

若为 TRUE,则打印距离矩阵的对角线

upper

若为 TRUE,则打印距离矩阵的上三角

p

闵可夫斯基距离的幂次(见下文 LCTT 译注)

该函数提供的距离测量方法包括:欧式距离euclidean、最大距离maximum、曼哈顿距离manhattan、堪培拉距离canberra、二进制距离binary 和 闵可夫斯基距离minkowski,默认为欧式距离。

LCTT 译注:

欧式距离指两点之间线段的长度,比如二维空间中 A 点 和 B 点 的欧式距离是  ;最大距离指 n 维向量空间中两点在各维度上的距离的最大值,比如 A 点 (3,6,8,9) 和 B 点  (1,8,9,10) 之间的最大距离是 ,等于 2;曼哈顿距离指 n 维向量空间中两点在各维度上的距离之和,比如二维空间中 A 点 和 B 点 之间的曼哈顿距离是 ;堪培拉距离的公式是  ;二进制距离首先将两个向量中的各元素看作其二进制形式,然后剔除在两个向量中对应值均为 0 的维度,最后计算在剩下的维度上两个向量间的对应值不相同的比例,比如  V1=(1,3,0,5,0) 和  V2=(11,13,0,15,10) 的二进制形式分别是  (1,1,0,1,0) 和  (1,1,0,1,1),其中第 3 个维度的对应值均为 0,剔除该维度之后为  (1,1,1,0) 和  (1,1,1,1),在剩余的 4 个维度中只有最后一个维度在两个向量之间的值不同,最终结果为 0.25;闵可夫斯基距离是欧式距离和曼哈顿距离的推广,公式是 ,当  p = 1 时相当于曼哈顿距离,当  p = 2 时相当于欧式距离。

下面是使用欧式距离计算 age 列距离矩阵的示例:

> dist(bank$age, method="euclidean", diag=FALSE, upper=FALSE, p=2) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 2 3 3 5 2 4 0 3 5 5 29 26 24 29 6 5 2 0 5 24 7 6 3 1 6 23 1 8 9 6 4 9 20 4 3 9 11 8 6 11 18 6 5 2 10 13 10 8 13 16 8 7 4 2 11 9 6 4 9 20 4 3 0 2 4 12 13 10 8 13 16 8 7 4 2 0 4 13 6 3 1 6 23 1 0 3 5 7 3 7 14 10 13 15 10 39 15 16 19 21 23 19 23 16 15 1 2 4 1 28 4 5 8 10 12 8 12 5 11 16 10 7 5 10 19 5 4 1 1 3 1 3 4 20 9 17 26 23 21 26 3 21 20 17 15 13 17 13 20 36 25 16 18 7 4 2 7 22 2 1 2 4 6 2 6 1 17 6 3 19 19 5 8 10 5 34 10 11 14 16 18 14 18 11 5 6 15 31 12 20 1 2 4 1 28 4 5 8 10 12 8 12 5 11 0 9 25 6 6 21 8 5 3 8 21 3 2 1 3 5 1 5 2 18 7 2 18 1 13 7 22 12 9 7 12 17 7 6 3 1 1 3 1 6 22 11 2 14 5 17 11 4 23 14 11 9 14 15 9 8 5 3 1 5 1 8 24 13 4 12 7 19 13 6 2 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 ...

改用二进制距离的计算结果如下:

> dist(bank$age, method="binary", diag=FALSE, upper=FALSE, p=2) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 2 0 3 0 0 4 0 0 0 5 0 0 0 0 6 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 0 0 0 0 0 10 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53quantile 函数

quantile 函数用于计算数值向量 x 的分位数及其对应的概率。当设置 na.rm 为 TRUE 时,该函数将忽略向量中的 NA 和 NaN 值。概率 0 对应最小观测值,概率 1 对应最大观测值。该函数的语法如下:

quantile(x, ...)

quantile 函数接受以下参数:

参数

描述

x

数值向量

probs

概率向量,取值为 [0, 1](LCTT 译注:默认为 (0, 0.25, 0.5, 0.75, 1))

na.rm

若为 TRUE,忽略向量中的 NA 和 NaN 值

names

若为 TRUE,在结果中包含命名属性

type

整数类型,用于选择任意一个九种分位数算法(LCTT 译注:默认为 7)

digits

小数精度

传递给其他方法的额外参数

rnorm 函数可用于生成正态分布的随机数。它可以接受要生成的观测值的数量 n,一个均值向量以及一个标准差向量。下面是一个计算 rnorm 函数生成的随机数的四分位数的示例:

> quantile(x quantile(bank$age, probs = c(0.1, 0.5, 1, 2, 5, 10, 50)/100) 0.1% 0.5% 1% 2% 5% 10% 50% 20.0 22.6 24.0 25.0 27.0 29.0 39.0IQR 函数

IQR 函数用于计算向量中数值的 四分位距interquartile range。其语法如下:

IQR(x, na.rm = FALSE, type = 7)

参数 type 指定了一个整数以选择分位数算法,该算法在 Hyndman and Fan (1996) 中进行了讨论。下面是计算银行年龄四分位距的示例:

> IQR(bank$age, na.rm = FALSE, type=7) 16sd 函数

sd 函数用来计算一组数值中的标准差。该函数接受一个 数值向量numeric vector x 和一个逻辑值 na.rm。na.rm 用来设置在计算时是否忽略缺失值。该函数的语法如下:

sd(x, na.rm = FALSE)

对于长度为 0 或 1 的向量,该函数返回 NA。下面是两个例子:

> sd(1:10) 3.02765 > sd(1) NA

下面是计算 age 列标准差的示例:

> sd(bank$age) 10.57621

R 语言 stats 包中还有很多其他函数,鼓励你自行探索。



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