pcr应该就是最常规的pcr，以dna为模板，通过上下游引物，实现dna的扩增

实时荧光定量pcr也就是real-time pcr，原理有点多，其最大的作用是检测样品中的初始dna浓度。

rt-pcr一般情况下是指反转录pcr（reverse transcription），尽管有些资料上说实时荧光定量pcr也（realtime fluores-cence quantitative pcr）也简称rt-pcr，但是我觉得这是不对的，不推荐。基本操作过程是将所提取的rna进行反转录，然后将所获得的cdna作为模板，设计引物进行扩增，是一种检测基因表达的常用方法。

至于三者的关系，rt-pcr和实时定量pcr应该都属于pcr，在rna实验中，这二者都会应用到。例如你要比较2个组织中的某基因的表达差异，首先你要提取2个组织的总rna，然后通过rt-pcr检测该基因是否在2个组织中有表达，然后通过实时定量pcr测定该基因在2个组织中的表达量是否具有显著性差异。