临床生信SCI加分必备!ROC可视化教程看这篇就够了!你一定要试试!

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临床生信SCI加分必备!ROC可视化教程看这篇就够了!你一定要试试!

2024-07-15 15:31| 来源: 网络整理| 查看: 265

Step 3

根据要求,将预测变量VCAN导入检验变量中,结局变量Type导入状态变量中,并将状态变量的值设置为1;随后,在输出栏中勾选相应的内容,点击“确定”,进入结果界面;

Step 4

在结果中,我们可以看到总的positive事件有375项,negative事件有32项,即存在375个肿瘤组织,32个癌旁组织。而对于ROC曲线,其曲线下面积为0.853 (0.810-0.897),显示出该预测变量对癌和癌旁具有较好的区分效能;同时,右键“导出”即可将ROC曲线进行保存。

二、基于R软件绘制ROC曲线

1、ROC曲线的绘制

Step 1 R包的安装与引用

#install.packages("ROCR")#install.packages("rms")library(ROCR)library(rms)

br

在此,我们主要通过使用R的ROCR包,来进行ROC 曲线的构建与绘制。

Step 2 数据的载入

rt



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