【代谢组学】技术文档 |
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小/大鼠粪便样本 1、样本量要求 1.1 16S/18S/ITS 扩增子测序:小鼠≥ 3 粒,大鼠≥ 2 粒 1.2 宏基因组测序:小鼠≥ 5 粒,大鼠≥ 3 粒 2、样本收集 2.1 将待取样的小 / 大鼠放进干净的铺有消毒滤纸的笼子里,等待小 / 大鼠排便后(可提起小鼠尾巴帮助排便)立即收集粪便样本,不同的小鼠取样要更换新的滤纸; 2.2 单个小 / 大鼠用灭菌离心管收集样本,分装好且标记好后立即放入 -80℃保存(有条件使用液氮冻存后再放入 -80℃保存); 2.3 若单个小 / 大鼠粪便样本不满足要求量,根据课题需求,可以将多个小 / 大鼠粪便样本混合为一个样品。 3、注意事项 如果需要做粪便微生物与代谢产物关联分析。则需要额外多取 2 粒的样本用于代谢组分析。且需要提前分装后冻存。 4、样本运输 需使用足量干冰保温运输。 5、建议:样本长期保存须知 若长期保存建议-80℃储存。 肠道内容物 瘤胃微生物 1、样本量要求 1.1 大型动物,如牛、羊:5-10 g/ 管; 1.2 中型动物,如大鼠、家兔:2-10 g/ 管; 1.3 小型动物,如小鼠:200-500 mg/ 管; 1.4 对于肠道内容物较少动物,如鱼、虾:≥ 200 mg/ 管。 2、样本收集 2.1 用无菌解剖刀在无菌状态下取出消化道内容物并置于无菌冻存管中; 2.2 放在冰盒中(建议用干冰)运回实验室,立即进行 DNA 抽提; 2.3 如果不能立即抽提,建议将样本先置于液氮中冷冻,再转移到 -80℃保存。 3、注意事项 为保证实验顺利进行,在采样允许的情况下,尽量多采集样品,一式多份。以上样本量适用于 16S 测序与宏基因组测序。 4、样本运输 需使用足量干冰保温运输。 5、建议:样本长期保存须知 若长期保存建议-80℃储存。 小编提醒: 1、重要的事情说三遍~~ 避免反复冻融! 避免反复冻融! 避免反复冻融! 绝大多数冷冻实验样本都有避免 反复冻融的要求,应养成好习惯, 尽量在初次冷冻之前分装。 2、足量干冰的意思是: 样本直到运到实验平台开箱时, 都应保持最初的冷冻状态,确 保温箱内剩余干冰不少于1kg, 理论上干冰越多越好,但考虑 到干冰采购和运输成本问题, 够用即可,通常情况,30-35℃ 气温时,以每日不少于3kg挥发 量估算为宜,气温更高时应加量。 3、还有一个不容忽视的问题: 寄送样本应选用最快的物流方式, 尽量避开“6.18”“双11”“双12”“年货 节”之类的电商混战日和节假日, 到达时间尽量避开节假日和周末。 最后说一句: 科研道路千万条,影响因子第一条, 方法整不对,说啥都是泪…… 返回搜狐,查看更多 |
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