python处理DICOM并计算三维模型体积

来源：中文源码网    浏览： 次    日期：2019年11月5日

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python处理DICOM并计算三维模型体积在已知DICOM和三维模型对应掩膜的情况下，计算三维模型的体积。

思路：

1、计算每个体素的体积。每个体素为长方体，x，y为PixelSpacing，z为层间距

使用pydicom.read_file读取DICOM文件，dcm_tag.PixelSpacing获取像素间距，dcm_tag.SliceLocation 获取层间距

2、计算体素的个数

代码如下：

from PIL import Image

import numpy as np

import pydicom

import os

def get_pixels_No(bmp_data_dir):

pixels_No = 0

bmp_files = os.listdir(bmp_data_dir)

for bmp in bmp_files:

bmp_file = os.path.join(bmp_data_dir,bmp)

img = Image.open(bmp_file)

img_array = np.array(img)

# img_array.dtype为布尔类型，需要转换为Int类型，其累加和恰好为体素总和

img_array_int &#