可以直接使用dos命令，pip install modulename(联网）

或下载安装包解压后使用python setup.py install

参考

github

将Inherit global site-packages这个选项勾选,应该可以解决大部分的问题了吧!

对于上面的问题，是python的虚拟环境引起的问题，如果安装了module，需要对虚拟环境进行配置，之后就可以进行使用了，不配置的话就需要点击Inherit global site-packages，或者existing interperter，这样就默认不适用虚拟环境，然后选择一个解释器即可。

选择“Create New Project”来创建新项目就会打一个创建项目的向导页。

在如上图所示的界面中，我们可以选择创建项目的模板，包括了纯Python项目、基于各种不同框架的Web项目、Web前端项目、跨平台项目等各种不同的项目模板。如果选择Python的项目，那么有一个非常重要的设定是选择“New environment…”（创建新的虚拟环境）还是使用“Existing Interpreter”（已经存在的解释器）。前者肯定是更好的选择，因为新的虚拟环境不会对系统环境变量中配置的Python环境造成影响，简单举个例子就是你在虚拟环境下安装或者更新了任何三方库，它并不会对系统原有的Python解释器造成任何的影响，但代价是需要额外的存储空间来建立这个虚拟环境。

最后发现是anaconda安装以后，interpreter没有设置成anaconda导致的

参考

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生信处理基因序列--未完待续

出现原因，在网上搜索，大部分都是python的文件和包文件冲突，

例如 import pymysql

python文件也叫pymysql.py

我遇到的问题是python的包的权限是root，但是用的是其他用户来查询的。

pip install -i numpy

打开cmd，输入以上代码，安装的很快，用的国内源安装

比pip install numpy要快好多

虽然使用python有不少时间了，但是基本没有在windows环境下使用，这不就踩了不少坑，特此记录如下：

安装完成后，发现没有python命令，这个是环境变量的问题，添加就可以了。但是也找不到pip 命令，而进入python里面，可以import pip 模块。这时候，需要用 “python -m ensurepip ” 来生成pip命令了，生成之后添加到环境变量就可以直接使用了, 默认情况下pip的路径： Python_install_path\scripts\pip.exe ， 在较新的python版本里面，已经默认会生成pip 命令，也就是说不需要上述步骤就有pip 命令可以使用了.需要注意的是：

如果遇到执行pip.exe 时候报错： Fatal error in launcher: Unable to create process using '"' ， 那么可以尝试用： python FULL/PATH/OF/PIP/COMMAND 来替带直接运行 pip, 貌似是无法找到合适的解释器来运行pip造成的.

如果发现系统中已经安装了python,但是缺少需要的module, 需要自己安装，可是不是管理员权限，没办法安装，python 提供了解决办法，方法如下：

A.

使用python -m site 命令，该命令会输出python的sys.path变量的值，以及其他的变量，见如下内容,其中我们可以看到有两个变量：USER_BASE, USER_SITE. 我们可以把需要的module 安装到USER_SITE下.

如果不存在相应的路径，那么我们可以创建.

B.

有了上述的路径后，我们在安装3rd module 的时候，就可以指定安装路径了：

pip install MODULE_FILE.PY --target=ABOVE\USER_SITE\PATH

上述方式安装之后，只有当前用户可以使用这些新装的module, 其他用户是不可以的.

其实这个不能算windows平台的坑了，一般不能import 都是缺少依赖的问题。 那么我们可以返回pip 命令，首先要知道这个module 的路径，通过路径中其他的信息确认这个module所属的package.

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