PRIMER 多元统计分析软件

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PRIMER 多元统计分析软件

2023-05-07 04:12| 来源: 网络整理| 查看: 265

原标题:PRIMER 多元统计分析软件

全球数以千计的研究者相信PRIMER在多元分析中的独创性和清晰性。

PRIMER提供了广泛的单变量、图形化和多变量例程,用于根据群落生态学中的样本数据分析物种阵列。

数据通常包括丰度、生物量、面积(或线)覆盖、存在/不存在等。并出现在环境影响的生物监测和更基础的生态学研究中。还涉及物理值和化学浓度的矩阵,这些矩阵本身或与生物组合数据并行分析,例如,检查生物变化与物理化学条件的共同变化。

尽管对生物组合数据的分析要求是一个主要的关注点,但该软件包同样适用于(并且越来越多地被应用于)其他多元或可以被视为多元的数据结构。

统一的特征是,所有的数据集都可以简化为一个合适的三角形矩阵,表示每对样本在组合、生物标志物组合、粒度分布、生长曲线形状等方面的相似性。聚类和排序技术可以显示样本之间的关系,排列测试用于测试假设。

稳健性

这些方法很少,如果有的话,也是对数据形式的假设。非度量排序和排列测试是该方法的基础,它易于实现,也易于理解。

应用广泛

这些方法可信度和透明度解释了PRIMER为什么被用于海洋、陆地和淡水生态、林业、土壤科学、遗传学、水产养殖、分类学、微生物学、医学、经济学等领域。

备受赞誉

20多年来,社区生态学和生物多样性研究的全球“标准”,由被高度引用和全球认可的研究人员引领。

PRIMER工作区(*.pwk)

在一个单一的交互式和直观的图形化Windows环境中,同时处理多个数据集、图形和输出文件。

使用树状的导航窗格轻松跟踪所有工作。

从Excel, .csv, .txt或3列格式中输入或输出 数据。

在屏幕上查看和更改绘图和图形的颜色、字 体、外观和感觉。

复制/打印/导出结果到.jpg、.emf、.tif、

.gif、.png、.bmp或.rtf文件。

指定分析的能力和灵活性。

识别样本或变量的重要子集。

定义测试和显示的组结构。

展开全文

处理相对较大的数据集(仅受可用Windows内存的限制)。

根据指定的条件合并或拆分数据。

释放内置矩阵显示和核心分析向导的省时功能。

多元分析不仅仅是一堆单变量的部分。通过探索和揭示高维数据的显著结构,实现高维数据的整体视图。

排序

用于可视化数据的排序技术,包括主成分分析(PCA),加上非度量、度量或阈值度量多维尺度(nMDS、mMDS、tmMDS)。

在2d或3d中可视化高维数据。定制文本、颜色和符号。使用叠加添加基本信息,如集群、轨迹、气泡、图像、向量或最小生成树。

使用引导来显示MDS图上的置信区域。旋转、展开、转动、设置动画、保存和分享您富有洞察力的图像。

执行分层聚类到样本(或变量)组,使用单个、完整、组平均或灵活的beta链接选项。

创建共距矩阵并绘制树状图。定制、旋转、折叠、放大或在多个页面上打印它们,以捕获所有更精细的细节。

相似性概要(SIMPROF)和相关的排列测试确定 了 样本组或物种组的一致性。

分裂聚类方法可以是不受约束的(UNCTREE),也可以受环境(或其他)变量的约束(LINKTREE),而krCLUSTER则是k-means聚类的非参数版本。

阴影图和热图

非参数检验

生物多样性分析

大量的手册和例子等等。返回搜狐,查看更多

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