2023届高三生物三轮复习专题PCR中引物的设计-金锄头文库

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2024-07-12 11:28| 来源: 网络整理| 查看: 265

1、高三生物提优 核酸配对/核酸阅读/引物设计 专练【课程标准】3.1.2 概述DNA分子是由四种脱氧核苷酸构成,通常由两条碱基互补配对的反向平行长链形成双螺旋结构,碱基的排列顺序编码了遗传信息5.1.3 阐明基因工程的基本操作程序主要包括目的基因的获取、基因表达载体的构建、目的基因导入受体细胞和目的基因及其表达产物的检测鉴定等步骤【学习目标】1. 回顾基础,理解5-3方向的成因、核酸双链反向平行的原因;2. 能画出并说明基因中编码链和模板链的区别和特点,能对5-3方向、转录方向(阅读方向)、模板链编码链的逻辑三角三缺一进行判断;3. 能用完整的语言分析常见基因工程题目中基因表达载体构建的理由(研究目的)和过程,这对理解题目设问十分重要;4. 能根据已有序列和信息完成引物的书写。【真题回顾】1(2022山东25)某种类型的白血病由蛋白P引发,蛋白UBC可使P被蛋白酶识别并降解,药物A可通过影响这一过程对该病起到治疗作用。为探索药物A治疗该病的机理,需构建重组载体以获得融合蛋白FLAG-P和FLAG-P。P是缺失特定氨基酸序列的P,FLAG是一种短肽,连接在P或P的氨基端,使融合蛋白能与含有

2、FLAG抗体的介质结合,但不影响P或P的功能。(1)为构建重组载体,需先设计引物,通过PCR特异性扩增P基因。用于扩增P基因的引物需满足的条件是_、为使PCR产物能被限制酶切割,需在引物上添加相应的限制酶识别序列,该限制酶识别序列应添加在引物的_(填“3端”或“5端”)。(2)PCR扩增得到的P基因经酶切连接插入载体后,与编码FLAG的序列形成一个融合基因,如图甲所示,其中“ATGTGCA”为P基因编码链起始序列。将该重组载体导入细胞后,融合基因转录出的mRNA序列正确,翻译出的融合蛋白中FLAG的氨基酸序列正确,但P基因对应的氨基酸序列与P不同。据图甲分析,出现该问题的原因是_。修改扩增P基因时使用的带有EcoR识别序列的引物来解决该问题,具体修改方案是_。难点分解思考1、(2)第二空的答案你是怎么写的?是否严谨?思考2、你如何设计上游引物?思考3、为什么答案不能改成在引物的EcoRI序列的5添加2个碱基?思考4、请尝试书写下游引物。它和哪条链配对?【错题例题重做】2、将野生型暗红眼和突变型亮红眼茶因进行测序,下图为编码链的部分测序结果。已知转录从第1位碱基开始,据图可知亮红眼突变体

3、的基因内发生_,造成蛋白质翻译到第_位氨基酸后提前终止(终止密码子:UAA、UAG、UGA)。3、研究发现,大部分白血病患者细胞中存在异常的融合基因UBA2WTIP,可作为检测白血病的特异性分子标志物。科研人员通过RTPCR方法克隆得到融合基因UBA2WTIP,为了研究该基因的作用和致病机制,需要构建重组载体并把目的基因和FLAG标签基因序列连接起来,分别获得带有FLAG肽链的UBA2WTIP融合蛋白和WTIP蛋白。FLAG肽链由8个氨基酸残基组成,可作为基因工程中蛋白质是否表达的标记。(2)为了构建重组载体,科研人员设计了以下2种引物:上游引物F2为:5 TATGGTACCATGGCACTGTCGCGGGGG 3,GGTACC为Kpn I酶切位点;下游引物R2为:5 TATTCAGAGCTCCGTGACGTG 3;FLAG标签基因编码链序列(5 GATTACAAGGATGACGACGATAAG 3)可以插入目的基因编码区的首端或者末端。若UBA2WTIP融合基因编码的蛋白质前端有一段引导进入内质网的信号肽,则FLAG标签基因序列一般不能插入位置,原因是_;下游引物R2处应分别插入_(

4、选填“FLAG标签基因序列”、“RcoR I酶切位点序列”)序列,并写出位置处序列为5_3。(已知5-AUG-3为起始密码子,5-UAG-3、5-UGA-3、5-UAA-3为终止密码子)参考答案1(1)能与P基因母链的一段碱基序列互补配对、短单链核酸 5端(2)P基因编码链的第一个碱基与EcoR识别序列的最后两个碱基编码一个氨基酸,导致mRNA的密码子被错位读取。 在引物中的EcoR识别序列3端添加1个碱基2、碱基对的缺失和替换 4433、蛋白质前端的信号肽一般会在蛋白质成熟时被切割掉,所以不能得到带有FLAG肽链的蛋白质。 FLAG标签基因序列 CTTATCGTCGTCATCCTTGTAATC【难点突破】4稻米胚乳直链淀粉含量高会导致食用品质差。研究发现,水稻蜡质基因(Wx)编码直链淀粉合成酶,从1位置转录起始。若Wx基因中第226位碱基是正常的G,该位点所在的内含子能在细胞核内被正常剪接,产生高活性的酶,胚乳中直链淀粉含最高,基因型记做GG;若该位点突变成T,则不能被正常剪接,胚乳中直链淀粉的合成水平会降低,基因型记做TT。5-GTATAC-3为限制酶Acc I的识别序列,酶切位置

5、如图所示。为检测Wx基因该位点碱基是G或T,研究人员以待测水稻叶片总DNA为材料,以Wx基因片段设计引物如图所示,对PCR扩增产物经Acc I酶切后电泳。已知两引物之间无另外的Acc I酶的识别位点。(1)请写出引物1和引物2的序列。引物1:5-_-3引物2:5-_-3:(2)与基因的编码链结合的是引物_。(3)为检测GT杂合型水稻品种Wx基因表达情况,提取GT杂合型水稻品种胚乳总RNA,经_获得cDNA,用引物1、2进行扩增、酶切、电泳,可以获得_种片段。5酯酶结合荧光分析法可对有机磷和氨基甲酸酯类农药进行检测,某研究院利用转基因技术获得一种催化效率高、农药敏感性强的微生物酯酶。(1)人工合成酯酶基因后通过PCR技术可实现扩增,需要设计_种引物,设计引物的作用是使DNA聚合酶能够从引物的_开始连接脱氧核苷酸。为构建目的基因方向正确的重组质粒,需要在引物的_端设计限制酶_的识别序列。设计引物时,常在引物的末端连接CCC碱基保护引物。某质粒图谱和目的基因的序列如图所示,请设计20位的下游引物序列:5-_-3。(5-AUG-3为起始密码子,5-UAG-3为终止密码子)限制酶识别序列与切割位

6、点限制酶识别序列与切割位点Pst5-CTGCAG-3Nde5-GATC-3Hind5-AAGCTT-3EcoR5-GAATTC-3Dpn5-GATC-3Alu5-AGCT-36、环糊精是食品、医药和化妆品工业中常用原料,而环糊精葡萄糖糖基转移酶(CGT酶)生产糊精为、和的混合物,分离纯化十分不便。江南大学一实验室通过蛋白质工程,提高了芽孢杆菌CGT酶的反应特异性。根据X射线衍射实验结果,证实与底物有相互作用的372位天冬氨酸和89位酪氨酸是酶催化特异性的关键位点,分别替换为侧链较长且含有氨基N的赖氨酸、亲水性更强的精氨酸后形成的双突变产物催化特异性提高了27倍,催化效率提高了1.24倍。(1)重叠PCR是常用的DNA定点突变技术,其原理如图所示。要完成两处位点的突变,至少要设计_种引物。(2)如图是该酶编码链的部分序列,请你设计替换372位天冬氨酸到赖氨酸的FP2和RP1引物。FP2:5-_-3RP1:5-_-3可能用到的密码子:天冬氨酸:5-GAC-3,5-GAU-3;赖氨酸:5-AAA-3,5-AAG-3参考答案4、(1)引物1:5-GCTTCACTTCTCTGCTTGTG-3 引

7、物2:5-ATGATTTAACGAGAGTTGAA-3(2)2(3)逆转录 45、(1)2 3端 5 EcoR I和Hind III 5-CCCAAGCTTCTAGTCGAACA-36、(1)6(2)TAGACCGGCGATGGCAAACCCAACAACCGG 和 CCGGTTGTTGGGTTTGCCATCGCCGGTCTA或答:TAGACCGGCGATGGCAAGCCCAACAACCGG 和 CCGGTTGTTGGGCTTGCCATCGCCGGTCTA【模拟演练】7幽门螺杆菌(Hp)是慢性胃炎、淋巴增生性胃淋巴瘤的主要致病菌,该菌的Ipp20基因能合成其特有的蛋白质,据此,研究者利用基因工程制备Hp疫苗。已知Ipp20基因表达时,双链DNA的一条链是编码链,另一条链是模板链,如图1;四种限制酶及其识别序列如图2;三种质粒如图3,箭头表示限制酶的切割位点;回答下列问题:(1)Ipp20基因终止子序列位于图1中的_区段,该基因转录时,编码起始密码子的序列位于图1中的_区段。(2)转录产生的mRNA前8个碱基序列为_(方向为53)。若通过PCR技术大量扩增Ipp20基因的编码区段,则需要设计一对引物,其中结合到编码链上的引物序列是_(方向为53,写出5端8个碱基序列)。(3)据图1、2、3分析,构建基因表达载体时,应选用的限制酶是_,最适合用作载体的质粒是_。8为研究干旱胁迫基因LEA和VOC对甘蓝型油菜油脂的积累机制,科研人员构建了两个基因表达载体。其中基因LEA与荧光素酶基因(Luc) 构建成基因表达载体甲,基因VOC和标记基因构建成基因表达载体乙,相关序列及酶切位点如图所示。箭头表示转录方向。(1)利用PCR扩增LEA基因时,需要在引物的_(填“3端”或“5端”)添加限制酶识别序列,添加序列对应的限制酶是_, 选择上述酶的依据是_。(2)为了构建基因表达载体甲,依据图中已知碱基序列,在PCR扩增仪中加入的引物的碱基序列为_,扩增_代后会得到等长的8条DNA片段。参考答案7(1) 非编码区2 编码区(2) 5CUCGAGAU 5TCTAGAGG(3) XbaI、XhoI 质粒Z8(1) 5端 EcoRV和Xbal L

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